Диагностика SARS-CoV-2 инфекции. Конкурент ПЦР?

Dec 06, 2020 21:46


В этом году слово ПЦР прочно вошло в повседневный лексикон. С помощью ПЦР и, реже, других методов амплификации нуклеиновых кислот диагностируют SARS-CoV-2 инфекцию (об этом подробнее здесь: https://prof-afv.livejournal.com/6425.html; https://prof-afv.livejournal.com/5607.html). Однако, этот пост не о ПЦР. Я понимаю, что то, как работают методы ( Read more... )

crispr/cas9, Диагностика, covid-19, cas13a, sars-cov-2, ПЦР

Leave a comment

Comments 72

woj_lj December 7 2020, 02:24:16 UTC
Интересный подход. А нельзя ли аналогичным образом "резать" сам вирус in-vivo?

Reply


alexey_zharikov December 7 2020, 03:03:46 UTC
Все эти методы определяют только наличие вируса в образце - а не то, болен ли этим вирусом человек. С таким же успехом можно тестировать на вирусы воздушный фильтр, что покажет только наличие вируса в воздухе.

Reply

woj_lj December 7 2020, 03:23:24 UTC
Все зависит от целей тестирования. Если задача найти и изолировать потенциальных носителей, то такой тест отлично годится. Если в образце есть вирус, то человек может быть заразен даже если сам не болеет.

Reply

alexey_zharikov December 7 2020, 04:36:14 UTC
Миф о заразных бессимптомных носителях уже опровергнут. На сегодняшний день консенсус такой, что заразны только те, у кого есть симптомы болезни.

Reply

mentalaggressor December 7 2020, 05:07:32 UTC
1. Тут слово "миф" неуместно, уместно слово "гипотеза".
2. Не видел, что вот прям опровергнуто. То есть доказано, что бессимптомные носители не могут распространять инфекцию.

Reply


(The comment has been removed)

prof_afv December 7 2020, 14:24:55 UTC
"Oчищенная вирусная РНК" была экстрагирована из клинических образцов и культуральной жидкости вирус-продуцирующих культур клеток. Её концентрация соответствовала таковой в реальных клинических образцах.
Вопрос только в том, возможно ди будет настолько упростить процедуру приготовления образца, чтобы она не требовала специального оборудования и реагентов, была бы быстрой и нетрудоёмкой. Например, для ОТ-ПЦР на РНК SARS-CoV-2 образец можно "приготовить" простым кипячением.

Reply

(The comment has been removed)

prof_afv December 7 2020, 20:53:55 UTC
А Вам не приходило в голову, что прежде, чем рекомендовать какой-нибудь упрощённый метод экстракции вирусной РНК из клинических образцов, его проверяют параллельно "готовя" образцы для тестирования в ПЦР классическим и упрощённым методами из одних и тех же клинических образцов?

Reply


polit_buro December 7 2020, 07:39:42 UTC
А что сейчас пошла за волна по поводу белка syncytin-1, находящегося в плаценте и якобы в вакцинах от ковида и могущего вызвать формирование антител к нему и бесплодие?

Reply

prof_afv December 7 2020, 14:34:39 UTC
Чепуха. Миф, распространяемый анти-вакциночниками.
Если будут попытки распространять это через мой блог, буду блокировать.

Reply

polit_buro December 7 2020, 15:52:48 UTC
Не надо меня блокировать ))). Как же разобраться, если не спрашивать.

Reply

prof_afv December 7 2020, 19:50:53 UTC
Уважаемый! Я не могу отвечать на любой вопрос, который интересует читателя. Поэтому я ввёл правило - вопросы должны быть в контексте поста.
Что касается Вашего вопроса, то я высказал своё мнение. Если моей оценки Вам недостаточно, изучайте этот вопрос самостоятельно, гугл и яндекс Вам в помощь. Но учтите, чтобы адекватно разобраться, нужны специальные знания (биохимии, молекулярной биологии, вирусологии, иммунологии и т.д.).
По поводу темы «вакцинация вызывает бесплодие» я предупредил (это касается всех читателей блога), использовать мой блог для распространения этого мифа я не позволю - такие комментарии будут блокироваться.

Reply


stalinist December 7 2020, 17:36:53 UTC
Каким образом вводятся специфические для вируса данные, которые позволяют идентифицировать его?

Reply

prof_afv December 8 2020, 15:14:55 UTC
Не понял вопрос

Reply

stalinist December 8 2020, 16:39:26 UTC
Тест должен выявить определённый вирус. Как экспериментатор говорит своей тестовой установке, какой именно вирус надо выявить?

Reply

prof_afv December 8 2020, 17:41:16 UTC
Геном вируса это РНК с определенной последовательность нуклеотидов. А этой РНК выбирается тот участок, в котором последовательность характерна только для этого вируса ("мишень"). Далее готовятся "зонды" которые могут связываться только с этим участком (последовательность нуклеотидов в них комплементарна "мишени"). Есть очень много способов, как зарегистрировать специфической связывание "зонда" с "мишенью". Об этом коротко рассказать невозможно.

Reply


Leave a comment

Up