(Untitled)

[vigna]

Comments

[prokhozhyj]

 Ой... :))

[al_chemist]

А велик ли участок-то?

[vigna]

Что-то около 20С + 30Т, между ними ещё, возможно, несколько повторов СТ. Иллюмина на этом месте дает резкое падение качества - с >35 до <10 и полный разнобой в числе и составе букв. Сэнгерник выдаёт классическую картинку типа такой: http://seqcore.brcf.med.umich.edu/doc/dnaseq/trouble/polslip.GIF

[bret]

я думал, что ligation-based с этим хорошо справляется, не?

[_hellmaus_]

Кстати да, как Solid относится к таким повторам?

[vigna]

http://vigna.livejournal.com/172780.html?thread=4258540#t4258540

[vigna]

Ну я думала, что Иллюмина с этим хорошо справляется - и что таки? :(
Там ведь тоже есть стадия амплификации - а значит, если проблемы из-за того, что получается неоднородный кластер (или как там это в солиде называется, группа молекул-потомков одного фрагмента), то они останутся. Если из-за вторичных структур, то тоже.

[roni_14]

:(

[nomadmoon]

Надо бороться в гомополимерофобией!
Гомополимерам равные права с гетерополимерами!