Чем занимается часть нашей лабы. ДНК как носитель информации

[reimei]

Увидела статью в Newsweek про успехи проекта "ДНК-носитель информации", который несколько человек из нашей лабы в коллаборации с другой лабой и Microsoft Research

Comments

[ditour]

Насчёт розового порошочка - 10 TB это одна длинная молекула, или "читалка" должна восстановить последовательность из многих?

[reimei]

Не, там много отрезков с физическим адресом вроде как. Для читалки по-любому надо фрагментировать.

[ditour]

Я тоже так подумал, но тогда многократное дублирование требуется - интересно, они его учитывали, когда 10 TB считали?

[reimei]

Я думаю, что не учитывали, потому что картинка там просто для наглядности - типа, вот сколько потенциально влезет. А вот где видео кодировали, там я не знаю, сколько пришлось дублировать. Но все равно по объему ДНК небольшая.

[exist_ence]

прикольно, а сколько времени заняла считка клипа и что там за процесс?

[reimei]

Секвенирование на Nextseq. Сейчас, конечно, довольно долго занимает - само секвенирование пара дней, не знаю, какой там объем и можно ли уместиться в один прогон. Плюс надо данные восстанавливать из фрагментов.

[saint_dragon]

Вроде бы эти идеи в воздухе уже лет десять витают, интересно, что получится в итоге. А ты не хотела бы в Майкрософте работать? По идее твои биоинформатические скиллз и биология им могут очень пригодиться?

[reimei]

Не знаю даже. Мои интересы все-таки ближе к биологии. Например, если программировать с помощью ДНК, то для того, чтобы использовать в клетках. Но в принципе, есть варианты, я не жестко ориентирована на академию.

[arky_titan]

Вот это да! Неожиданно и очень оригинально, очередной триумф мысли! :-)

[motek]

Ага, я ещё когда в институте Вейцмана училась 15 лет назад, там разрабатывали какие-то ДНКовые компьютеры. Утверждалось не только что ДНК может хранить кучу информации а что на них можно будет якобы решать "экспоненциальные" задачи (NP-complete problems). Вроде пока успеха нет особо. :)

[reimei]

Сейчас программированием с помощью ДНК\РНК тоже занимаются, и для диагностики, и logic gates в клетках внедряют всякие. Собственно, этим на постдоке занимался мой шеф, с помощью DNA strand displacement. Можно пространственно организовать молекулы ДНК на платформе и построить типа вычислительное устройство :)

[motek]

Wow, да, я вижу это уже во всю делают! Та группа похоже тоже весьма продвинулась.