Опять новые семейства и старые проблемы

[olnud]

Я уже писал об открытии новых семейств животных, т.е. когда одновременно описываются новый вид, новый род и новое семейство. Открыть новое семейство (а не установить его на основе известных видов!) - огромное везение, которое может стать для систематика орденом наивысшей доблести (выше, наверное, только открытие «живого ископаемого» вроде латимерии

Comments

[egor_13]

**Спешили побыстрей описать супер-новую находку?
Думаю, наверняка.

[olnud]

Китайцы боялись японцев, японец и сингапурец боялись австралийцев....

[nibope]

А в самом деле? Это ж ведь дело достаточно рутинное и недорогое. Я вот приводил пример своего друга-энтомолога, который официально в науке не работает, так он за собственные деньги занимается, все сам сделал - и описал, и отсеквенировал свою бабочку.

[britva_]

Кажется полный сиквенс коротких последовательностей на Illumina сейчас около $50,000-$100,000 а вот сборка и тем более нотация генов и прочих элементов стоит на порядок дороже и по прежнему требует значительных усилий. К сожалению во многих университетах к биоинформатикам по прежнему не слишком хорошее отношение, только когда совсем прижмёт начинают просить помощь. Если же сиквенировать только нужные фрагменты то на порядок дешевле и быстрее, для систематики как правило достаточно и этого.

[olnud]

Сиквенирование фрагмента COI в США-Канаде уже стоит около 9-12$. Фрагмент 16S в 1200-1400 п.н. (этого достаточно для простенького филогенетического анализа) в Москве можно отсиквенировать за 40-100 долларов, а можно договориться и включить аспиранта-молекулярщика в соавторы - тогда бесплатно. Найти заинтересованного в публикации человека - без проблем, особенно когда речь идет о новом семействе!

[britva_]

Да, совсем недорого, лет 10 назад ещё в Израиле жена отправляла на сиквенс фрагменты порядка 200-400 нуклеотидов, брали где-то по $50 за несколько семплов, как сейчас не знаю. Сотрудничество это хорошо но некоторые не хотят по своим причинам.

[britva_]

Во певых скорость во вторых действительно - пока пошлёшь образец пока сиквенируют, сравнят, надо делиться славой первооткрывателя. Там ведь не надо полный сиквенс, достаточно просканировать рибосомальные и иные консервативные последовательности. И конечно точность расположения в эволюционном и классификационном деревьях на порядок точнее. Краб красавец.