-
Полевое тестирование HT-сканера
Дисклеймер: описывается краткий отчёт по полевому испытанию портативной системы high throughput scanning.Обрабатываемыми материалами являлась багажная сумка, набитая всевозможными бумагами, документами, газетами, брошюрами и тетрадями. Также было несколько фотографий и физических артефактов ( Read more... ) -
Использование Rsamtools
Дисклеймер: это описание использования пакета Rsamtools на фоне реального анализа данных Ribosome ProfilingАдаптация samtools для R является основным средством импорта данных картирования NGS в R. Сопряжение со статистическим языком обеспечивает функционал, недоступный для самого samtools ( Read more... ) -
GenomicRanges
Дисклеймер: кратко основные вещи по Bioconductor GenomicRanges
library("GenomicRanges")
### Сборка объекта GenomicRanges с нуля
GenRange <- GRanges(
seqnames = Rle(c("chrX", "chrY", "chrZ"), c(1, 1, 2)), # задание "хромосом" и числа блоков на каждой как Rle
ranges = IRanges(start = c(1, 3, 19, 30), end = c(7, 5, 35, 40), names = c('One', ' ( Read more... ) -
На заметку для перестановки R
Дисклеймер: это чисто памятка для самого себя и не более.1) Свежак надо подключать вручную: в /etc/apt/sources.list добавлять и лучше никак не по другому deb http://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu precise ( Read more... ) -
FEBS 2013 СПб
Дисклеймер: это только лишь микро-отчёт о мероприятии, конечные выводы написаны только лишь для каких-либо конечных выводов и не претендуют на доказанность и серьёзность.
Конгресс FEBS в Санкт-Петербурге закончился. Желающие могут уточнить что это такое ( Read more... ) -
Open Goverment Data
Не предполагал что такое вообще возможно. Открытые массивы всевозможных статистических датасетов, как сырых, так и всячески процессированных. Для Этой страны это кажется нереалистичным.
http://data.gov.uk/
http://www.data.gouv.fr/ lifeblogging, идеологически верноеДелаем "обзор" по рибосомам для экзамена по английскому
Необходимо обработать 300 000 kchars и написать ~20 страниц текста ( Read more... )ОЛОЛО!
https://salis.psu.edu/software/RBSLibraryCalculatorSearchMode
DARPA финансирует работы по бактериальным рибсосомамПрактическая применимость форсированной выгрузки
Общее описание протокола форсированной выгрузки было дано ранее тут, более экспериментов по применению протокола ещё не было. Изначально он планировался как экстренный протокол, "алгоритм отчаяния", действия при необходимости выгрузить из человека как можно больше сейчас и с помощью сегодняшних технологий - он предполагается для умирающих с ( Read more... )
