Дисклеймер: это самодельный инструмент использования BASH, открытого API и анализа данных в R.

Подробная постановка задачи была описана здесь, потому не буду расписывать её. Принцип скрининга заключается в наборе сырых данных из базовых сведений пользователей сети Vk, принадлежащих каким-либо группам, последовательной фильтрации пользователей по ( Read more... )

Дисклеймер: просто оставлю это здесь.


( Read more... )

Дисклеймер: замечание основано на личном опыте и выражает только субъективное мнение.


( Read more... )

Дисклеймер: презентация и текст кафедрального отчёта как аспиранта 2 г.о.


Report chair from Sergey Evfratov1) Глубокоуважаемые коллеги! Данная работа посвящена изучению функциональной роли модификаций рибосомной РНК организма Escherichia coli. [слайд-заголовок ( Read more... )

Дисклемер: это лишь исполнение начальных рекомендаций от IT-сообщества по началу освоения практических методов Machine Learning (необходимых для решения задачи по системной биологии) и Text Mining (нужных для работы с научной литературой и ЦБ).

Самое первое, конечно-же, Coursera, базовая литература "An Introduction to Information Retrieval" от ( Read more... )

Дисклеймер: данный пост не предназначен к прочтению.


( Read more... )

Дисклеймер: это предварительный отчёт по проекту обработки семейного фотоархива

Массив фотографий из чемодана был оцифрован с помощью высокопроизводительного сканера за время ~2 рабочих дня. Глубина оцифровки технически исчерпывающая - не были оцифрованы только материалы, к которым поточное сканирование не применимо: очень маленькие фотографии, ( Read more... )

Дисклеймер: немножко про бесплатный и OpenSource GSP трекинг

GPSLogger на OS Android, для обработки  gpspurne на OS Ubuntu Linux

Физкультура:


( Read more... )

Дисклеймер - немного по GenomicFeatures и TxDb

library("GenomicFeatures")
library("TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene")
library("mirbase.db")
library("FDb.UCSC.tRNAs")

# что вообще есть?
supportedUCSCtables() # много всего, но закачкой, сборкой и загрузкой заниматься не будем, все организмы слишком модельные

# базовые штуки
txdb <- TxDb. ( Read more... )

Дисклемер - краткое описание функционала инструмента импорта/экспорта файлов геномных аннотаций.

rtracklayer используется как интерфейс между R, геномным браузером и геномными аннотациями. Главный функционал - ввод/вывод табулированных (в т.ч. сжатых) файлов геномных аннотаций: GTF/GFF, BED, WIG, BedGraph, BED15 и BigWig. Загружает файлы аннотаций ( Read more... )