Ещё один мошенник от пост-науки продаёт страшный и ужасный коронавирус!

[jescid]

Некто shvarz почти верно пересказал китайскую статью про коронавирус, получил массу благодарности от просветлённой новым знанием публики, но когда ему стали задавать вопросы (потому что приврал при пересказе в том месте, которое он не понял и/или же специально приврал для соответствия заданному нарративу) - начал хамить и удалил все мои комментарии

Comments

[dmitriyivanov6]

А что это вы нахамили и закрыли комменты в другой ветке? Ладно, отвечу здесь.Только дискуссия и обучение - это разные вещи. Поэтому говорю сразу, тратить время на обучение самоуверенных болванов(которые начитались в интернете и не поняли) я не намерен.

"И невозможно «автоматически» убрать ридсы, которые неотличимы, потому что тогда невозможно собрать те, которые соответствуют новому штамму - 15% его РНК было отлично от известных штаммов и тоже неизвестна, согласно статье: потому вирус сначала детектировали, а потом изолировали и размножили его РНК (с помощью того же RT-PCR) для дальнейшего анализа и секвенирования, результатом которого было то, что уже большинство из 20 тысяч ридсов отмаппили на известный бетакороновирус: most contigs matched to the genome from lineage B of the genus betacoronavirus - showing more than 85% identity with a bat SARS-like CoV"

Бред полнейший. Важным применением высокопроизводительного секвенирования является метагеномная характеристика экологических и клинических образцов. В отличии от методов ПЦР или массива, в которых исследователи ограничены известной информацией о последовательности и должны выбрать патогены, которые будут рассматриваться в эксперименте, высокопроизводительное секвенирование может быть беспристрастным и дать возможность инвентаризовать все древо жизни. Приложения и принципы подготовки проб для высокопроизводительных систем секвенирования одинаковы для разных платформ. Приготовление образца может быть направлено на конкретные таксоны либо путем обработки для удаления нуклеиновой кислоты, не защищенной вирусным капсидом, либо путем амплификации ПЦР, которая обогащает определенные последовательности, такие как 16S рРНК.(Например, анализы желудочно-кишечной или кожной флоры) или анализы, связанные с интересующими патогенами (например, вирус гриппа, и т.д.). После амплификации и секвенирования необработанные чтения последовательностей группируются в нередуцируемые наборы последовательностей. Уникальные чтения последовательностей собраны в смежные последовательности, которые затем сравниваются с базами данных с использованием программ, которые исследуют гомологию на уровне нуклеотидов и аминокислот с использованием всех шести потенциальных рамок считывания. Поэтому китайцы в своей работе взяли всю РНК, отсеквинировали, получили 20 тыс. вирусных считываний из которых составили контиги, большинство из этих контигов совпали с коронавирусами.

Другую ветку надо указывать

[jescid]

Дабы ваше мошенничество и попытки высиров были лучше видны публике.
Это здесь.
Комменты там от вас заморожены, потому что вы не могли унять свой понос в перевирании статьи и аргументами стиля «сам дурак».
И обосрались про «принцип unbiased high-throughput sequencing».

Но как зарекомедовавший себя мошенник ссылку вы не указали.
И начали здесь нести свой высир нерелевантно.
Потому что копи-пастите с гугл переводчика, это же видно :)
Вы не используеьте профессиональную терминологию.
Никто не называет ридсы _вирусными_ считываниями :D
А вот какой пассаж из статьи вы загнали в Гугл - легко теперь догадаться - это «More than 20,000 viral reads from individual specimens were obtained» :D
Перевод на русский здесь такой:
«Более 20тыс считываний с вирусной РНК…»

Спасибо :)))
Вы - феномен!

> Важным применением высокопроизводительного секвенирования является метагеномная характеристика экологических и клинических образцов.

Остальной ваш копи-паст не имеет отношения к теме.

Но последнюю фразу вы попробовали написать сами и тут же опять обосрались.

> Поэтому китайцы в своей работе взяли всю РНК, отсеквинировали, получили 20 тыс. вирусных считываний…

Вся РНК из образа при метагеномном секвенировании - это порядка нескольких сот миллионов ридсов.
Из которых таки ~8-9% ридсов неотличимы на уровне видов.

P.S. когда вас, после терпеливого оппонирования нескольким 10кам ваших брехливых и безмоглых высиров, в которых вы со своим багажом лавочного торговца лезете кого-то учить, называют болваном это, конечно, обидно.
Но то, что вы настолько тупы, что не можете в ответ оппонента не назвать так же - это особо смешно.
Не лезьте, прошу вас.
Занимайтесь вашим делом - ваше место у прилавка и в торговом зале плясать перед публикой.