Новые геномы фатьяновской культуры
Волосово-Даниловский могильник: 1 - схема могильника с указанием погребений, откуда взяты образцы
для анализа ДНК; 2 - погребение 13. Фото, план, инвентарь; 3 - погребение 17. План, инвентарь.
Вышла еще одна статья по палеогенетике фатьяновцев. И снова отечественная. На сей раз - это публикация в свежем Стратуме. И очень здорово, что она в открытом доступе. Называется статья "Новые данные по фатьяновской культуре: анализ древней ДНК в погребениях Волосово-Даниловского могильника".
И вот о чем сообщает аннотация к ней:
"В последние годы фатьяновская археологическая культура, являющаяся локальным вариантом культуры шнуровой керамики и боевых топоров, стала популярным объектом генетических исследований. Ранее ее происхождение традиционно строилось на основании инвентаря и выводов антропологов. Сейчас решение вопроса о происхождении фатьяновцев, а также характера их взаимодействия с местным населением, во многом, зависит от результатов анализа древней ДНК, поэтому было начато повторное изучение материалов самого крупного из известных могильников - Волосово‑Даниловского. Проведено комплексное исследование археологической ДНК 11 мужских индивидов эпохи бронзы. Методом фрагментного анализа определены STR-маркеры Y-хромосомы, получены гаплотипы, указывающие на единство гаплогруппы исследованных индивидов, но также на отсутствие между ними близкого родства. По результатам NGS, выполненного с применением кастомной панели, надежно (с высоким покрытием) выявлены SNP маркеры, определяющие Y-хромосомную гаплогруппу R1a (Z93), фенотипические признаки, например, цвет глаз - карий, цвет волос - темный, цвет кожи - промежуточный. Проведен анализ признаков аутентичности археологической ДНК, оценена степень контаминации. Методами биоинформационного анализа по результатам NGS аутосомной части ДНК показана близость результатов секвенирования исследованных образцов археологической ДНК к опубликованным ранее, полученным для образцов, относящихся к фатьяновской культуре, другим научным коллективом иным методом."
Ну и можно несколько цитат дать:
"Предметом нашего исследования стали антропологические материалы из самого большого из раскопанных в Верхнем Поволжье Волосово-Даниловского могильника. Крупнейший погребальный памятник фатьяновской культуры находится в Ярославской области, в пятнадцати километрах к северо-северо-востоку от деревни Фатьяново. Здесь на площади ок. 2400 м 2 Верхневолжской экспедицией Института археологии АН СССР под руководством Д. А. Крайнова в 1962-1964, 1966-1969 гг. в 107 могилах были раскопаны погребения 117 индивидов (Крайнов, Гадзяцкая 1987: 58). Исследователем могильника отмечен довольно единообразный характер погребального обряда и сопровождающего инвентаря...
С использованием кастомной панели маркеров было осуществлено секвенирование Y-хромосомы 9-ти мужских индивидов фатьяновской культуры. Благодаря секвенированию Y-хромосомы подтверждены все гаплогруппы Y-хромосомы, ранее предсказанные по полученным STR гаплотипам Y-хромосомы) (табл. 1), и уточнены их субварианты (табл. 2).
В результате секвенирования Y-хромосомы 9-ти фатьяновцев были определены гаплогруппы Y-хромосомы (табл. 1). Минимальная глубина прочтения составила х18 прочтения, максимальная х1260 прочтения. У 8-ми индивидов была обнаружена одна и та же линия гаплогруппы R1a - R1a1a (М198) →R1a1a1b (S224) → R1a1a1b2 (F992 или Z93)
(табл. 1). Лишь у одного индивида (F16) была обнаружена неполная линия с одной мутацией R1a1a1b (S224) из-за низкого покрытия ДНК. В статье (Saag et al. 2021), в которой исследованы 18 мужских образцов из фатьяновской культуры, у 6 мужских индивидов также обнаружена гаплогруппа R1a1a1b2 (F992 или Z93) с удовлетворительным покрытием,
у 8-ми индивидов найдены предковые варианты R1a- M417 и R1a-Z645 с очень низким покрытием. И лишь у одного индивида была обнаружена гаплогруппа R1a5-YP1301. Здесь
мы наблюдаем большее разнообразие вариантов гаплогруппы R1a. Но важно отметить, что у большего числа образцов выявлены лишь предковые варианты с очень низким покрытием. Возможно, при достаточном покрытии Y-хромосомы, удалось бы выявить и их производные ветки.
Выраженные частоты (R1a1a1b2-F992 или Z93) сегодня встречаются в Южной Сибири среди алтайцев и хакасов (> 30 %), также сравнительно небольшие частоты встречаются среди татар Поволжья (5 %), в Кыргызстане (6 %) и во всех популяциях Ирана (1-8 %) (Underhill et al. 2015).
Анализ аутосомных маркеров
Сравнение генетических вариантов методом PCA, представленных в образцах F12 и F33, производилось с 33 образцами, проанализированными в статье (Saag et al. 2021)
(рис. 1). Число биаллельных SNP, использованных для анализа, составило 4253. С помощью PCA анализа показано, что образцы F12 и F33 фатьяновской культуры из Волосово-Даниловского могильника генетически близки к образцам, относящимся к той же культуре из ряда могильников (рис. 3), которые были опубликованными ранее (Saag et al. 2021).
Фенотипические признаки
Прогнозирование фенотипа было выполнено для всех образцов фатьяновской культуры. Для предсказания пигментации глаз, волос и кожи были секвенированы 41 пози-
ции из 19 генов в 9 аутосомных хромосомах и загружены в онлайн программу-предиктор HIrisPlex-S (https://hirisplex.erasmusmc.nl/). В результате предикции цвета глаз, волос и кожи оказалось, что все индивиды фатьяновской культуры были носителями аллелей, отвечающих за карие глаза, кожу промежуточных оттенков и каштановые волосы. В исследовании (Saag et al. 2021) по образцам из фатьяновской культуры получены аналогичные результаты
Заключение
Выделена ДНК из останков 11 мужских индивидов из фатьяновской культуры и проведено ее комплексное исследование. На начальном этапе был проведен фрагментный анализ Y-хромосомы и предсказаны гаплогруппы Y-хромосомы. По результатам фрагментного анализа обнаружено, что у фатьяновцев Волосово-Даниловского могильника и у носителей культуры шнуровой керамики из Ойлау имелось сходство предсказанной одной гаплогруппы Y-хромосомы. Эти группы объединяет и наличие специфических боевых травм, что может указывать на общность культурных традиций.
С помощью NGS были уточнены субварианты гаплогруппы R1a индивидов из фатьяновской культуры. У восьми индивидов из девяти была обнаружена одна и та же линия гап-
логруппы R1a - R1a1a (М198) → R1a1a1b (S224) → R1a1a1b2 (F992 или Z93). Лишь у одного индивида (F16) была обнаружена неполная линия с одной мутацией R1a1a1b
(S224) из-за низкого покрытия ДНК. Выраженные частоты гаплогруппы R1a1a1b2 (F992 или Z93) встречаются в Южной Сибири среди алтайцев и хакасов (> 30 %), так же
сравнительно небольшие частоты встречаются среди татар Поволжья (5 %), в Кыргызстане (6 %) и во всех популяциях Ирана
(1-8 %) (Underhill et al. 2015). Определены некоторые фенотипические признаки, характерные для исследованных представителей фатьяновской культуры: цвет глаз - карие, кожа средних оттенков и каштановые волосы.
Была подтверждена аутентичность древней ДНК, с помощью расчета частот C/T и G/A модификации и контаминации по X-хромосоме. С помощью анализа методом PCA показана близость результатов секвенирования образцов 12 и 33 фатьяновской культуры из Волосово-Даниловского могильника с результатами, опубликованными ранее по образцам, относящимся к той же культуре из ряда могильников (Saag et al. 2021). В результате исследований ДНК выявлена определенная однородность фатьяновского населения, которая также прослеживается в единообразии археологических материалов".
Сама статья в открытом доступе
А. В. Энговатова, Х. Х. Мустафин, И. Э. Альборова (Москва, Россия), А. А. Канапин, А. А. Самсонова (Санкт-Петербург, Россия), М. Б. Медникова (Москва, Россия)
Новые данные по фатьяновской культуре: анализ древней ДНК в погребениях Волосово-Даниловского могильникаhttps://www.e-anthropology.com/Katalog/Arheologia/STM_DWL_1Li9_FgIdcUnYJ0xe.aspx