Эволюция лентивирусов
Очень хороший обзор: Viral evolution in deep time: lentiviruses and mammals https://doi.org/10.1016/j.tig.2011.11.003
Лентивирусы представляют собой особый род ретровирусов, вызывающих хронические стойкие инфекции у млекопитающих, включая человека. Появление пандемической инфекции ВИЧ в конце 20 века сформировало представление о лентивирусах как о «современных» вирусах. Однако недавние исследования выявили совершенно иную точку зрения, прояснив аспекты эволюционных отношений с млекопитающими, которые охватывают многие миллионы лет.
До недавнего времени лентивирусы считались «современной» ретровирусной группой. Подходы, основанные на применении молекулярных часов, оценивают возможность относительно недавнего происхождения, с временными рамками в несколько сотен или тысяч лет, предлагаемых для некоторых подгрупп. В отсутствие надежных ретроспективных данных нельзя исключать возникновения всего рода в относительно недавний период времени (например, менее 1 миллиона лет). Однако за последние годы значительный прогресс в секвенировании генома ускорил открытие эндогенных вирусных элементов (то есть локусов в геномах хозяина, которые происходят от древних вирусов). Среди разнообразного диапазона «окаменелых» вирусных последовательностей, которые были идентифицированы в геномах позвоночных, есть два эндогенных лентивируса; кроличий эндогенный лентивирус К (RELIK) у зайцевых и вирус проиммунодефицита (PSIV) у мышиных лемуров.
Лемур
фотка взята тут https://haritonoff.livejournal.com/275648.html
Филогенетическое дерево
Корень лентивирусного дерева остается неопределенным. Хотя заманчиво предположить, что RELIK и вирус инфекционной анемии лошадей (EIAV) являются базальными вирусами, поскольку оба имеют относительно простые структуры генома без гена фактора инфекционности вириона (vif). Следует отметить, что потеря гена также могла произойти позже.
Ну и как же не коснуться зверюшки 20 года, летучей мыши?
Лентивирусы представляют собой особый род ретровирусов, вызывающих хронические стойкие инфекции у млекопитающих, включая человека. Появление пандемической инфекции ВИЧ в конце 20 века сформировало представление о лентивирусах как о «современных» вирусах. Однако недавние исследования выявили совершенно иную точку зрения, прояснив аспекты эволюционных отношений с млекопитающими, которые охватывают многие миллионы лет.
До недавнего времени лентивирусы считались «современной» ретровирусной группой. Подходы, основанные на применении молекулярных часов, оценивают возможность относительно недавнего происхождения, с временными рамками в несколько сотен или тысяч лет, предлагаемых для некоторых подгрупп. В отсутствие надежных ретроспективных данных нельзя исключать возникновения всего рода в относительно недавний период времени (например, менее 1 миллиона лет). Однако за последние годы значительный прогресс в секвенировании генома ускорил открытие эндогенных вирусных элементов (то есть локусов в геномах хозяина, которые происходят от древних вирусов). Среди разнообразного диапазона «окаменелых» вирусных последовательностей, которые были идентифицированы в геномах позвоночных, есть два эндогенных лентивируса; кроличий эндогенный лентивирус К (RELIK) у зайцевых и вирус проиммунодефицита (PSIV) у мышиных лемуров.
Лемур
фотка взята тут https://haritonoff.livejournal.com/275648.html
Филогенетическое дерево
Корень лентивирусного дерева остается неопределенным. Хотя заманчиво предположить, что RELIK и вирус инфекционной анемии лошадей (EIAV) являются базальными вирусами, поскольку оба имеют относительно простые структуры генома без гена фактора инфекционности вириона (vif). Следует отметить, что потеря гена также могла произойти позже.
Ну и как же не коснуться зверюшки 20 года, летучей мыши?