Природный резервуар SARS-CoV-2 в популяциях белохвостых оленей
О COVID-19 и SARS-CoV-2 стали забывать. Но вирус не исчез. Более того, он нашёл для себя новые «ниши». Об одной их них сегодняшний пост.
Переносы инфекции от человека животным, по-научному, называются антропонозами (или антропозоонозами). Самими невезучими на «антропонозном поле» оказались норки - в Дании их практически полностью истребили (подробнее: https://prof-afv.livejournal.com/50017.html ). Сделано это было из-за опасения обратного «перескока» мутантного вируса на людей (зооноза/зооантропоноза). Эта тревога оказалась ложной. Но тогда, осенью 2020г., никто не знал, что все проблемные варианты SARS-CoV-2 (альфа, бета, дельта, омикрон) сформируются при циркуляции вируса исключительно в человеческих популяция.
Тем не менее, резервуар SARS-CoV-2 у животных потенциально опасен, особенно, если это природный резервуар (т.е. вирус циркулирует среди диких животных). В таком случае, инфекцию значительно сложнее контролировать и профилактические меры типа «избиения норок» вряд ли возможны.
Похоже, что, по крайней мере, один природный резервуар SARS-CoV-2 у животных уже сформировался. Люди «наградили» SARS-CoV-2 белохвостого оленя (Odocoileus virginianus). В США и Канаде обитает около 30 миллионов диких особей этого вида.
Белохвостые олени оказались чрезвычайно чувствительным к заражению SARS-CoV-2. Впервые это было обнаружено в 2021г (я об этом в своё время писал: https://prof-afv.livejournal.com/102033.html ). В последующем данное наблюдение было неоднократно подтверждено. А на днях были опубликованы результаты большого исследования SARS-CoV-2 инфекции у диких белохвостых оленей в США (https://www.nature.com/articles/s41467-023-39782-x ).
Объём проделанной работы впечатляет - в период с ноября 2021г до апреля 2022г были собраны мазки из носа и образцы крови от около 9000 диких оленей, обитающих в 26 штатах США и округе Колумбия. В 944 образцах был, с помощью ПЦР, обнаружен SARS-CoV-2. Геномные последовательности этих вирусов были определены в 391 образце (в 282 образцах - полные геномы). Геномы «оленьих» SARS-CoV-2 были сравнены между собой и с 14-ю миллионами геномов «человеческих» SARS-CoV-2.
Основные выводы этого исследования следующие:
1. Олени многократно заражались от людей (идентифицировано 109 антропонозных переносов)
2. SARS-CoV-2 «прижился» в популяциях оленей - 12% исследованных оленей продуцировали вирус и сравнение геномов позволило установить, как минимум, 39 случаев передачи вируса от оленя к оленю
3. У оленей были обнаружены все известные проблемные варианты SARS-CoV-2, появление которых в оленьих популяциях было синхронизировано с периодами циркуляций этих вариантов у людей. Однако, циркуляция данных вариантов среди оленей продолжалась и после их исчезновения из человеческих популяций
4. Обратная передача SARS-CoV-2 от оленей людям возможна - было идентифицировано, минимум, 3 случая такой передачи
Вызывает ли инфицирование оленей SARS-CoV-2 заболевание пока не ясно, но, скорее всего, в большинстве случаев эта инфекция у оленей протекает бессимптомно.
Какова потенциальная опасность этого природного резервуара вируса? Пока ничего настораживающего не замечено. Но, в принципе, эволюция вируса в оленьих популяциях, может «породить» новый, опасный для человека вариант SARS-CoV-2. Так-что, этот резервуар нужно мониторить, что, судя по этой публикации, довольно масштабно делается в США.
Имеет ли всё это какое-то отношение к России? Ведь белохвостый олень - это «коренной» обитатель Северной Америки. По крайней мере теоретически, нельзя исключить некоторую «релевантность» этого и для России. Дело в том, что белохвостые олени были завезены в Европу. В частности, они хорошо «прижились» в Финляндии. Есть и «нарушители границы», приходящие на территорию России. Сформировалась ли уже популяция белохвостых оленей в российских лесах, граничащих с Финляндией, не знаю. Есть в России и белохвостые олени, содержащиеся и разводимые в неволе (их число измеряется, как минимум, сотнями). «Подцепили» ли уже российские белохвостые олени SARS-CoV-2? Опубликованных данных об этом нет.
Наконец, заслуживает внимания и вопрос о возможности заражения SARS-CoV-2 оленей тех видов, которые обитают в в России. Научные публикаций по этому вопросу тоже пока нет.
Проф_АФВ