Waeschenbach et al. 2012 “A molecular phylogeny of bryozoans” авторы приводят данные о загрязненных сиквенсах мшанок, которые попал в те или иные работы. Кажется, а прочитал об этом у the-self.livejournal.com - и забыл. А тут, готовясь клекциям, решил показать студентам, к чему могут привести подобные ляпы. Ниже приведено древо из работы Fuchs, J
(
Read more... )
Comments 10
A kak eto izvestno stalo? BLAST?
Reply
Reply
Написать, что ли, программу, которая будет автоматически искать такие ошибки... У нас в лаборатории принято каждый новый сиквенс проверять Бластом, но видимо, не везде так делают.
Reply
Reply
Reply
А у меня одногруппница год назад пыталась мшанок секвенировать, да еще и корковых. Тоже получались сплошные фукусы-аскофиллюмы. Но она же не загоняла сразу всю эту нечисть в дерево, а сверялась с ГенБанком. К тому же, понять, принадлежат ли анализируемые особи к одной группе или, наоборот, аж к разным типам - прекрасно можно хотя бы по выравниванию.
Reply
Reply
Leave a comment