CyberElegans --> OpenWorm

Jun 06, 2011 22:05

Давно уже не писал, даже по своим меркам, однако, были и объективные причины для этого ( Read more... )

Leave a comment

Comments 18

combinator30 June 6 2011, 15:23:03 UTC
Спасибо, интересно.
А где можно поподробнее прочитать про используемую модель нервной системы (моделируется ли влияние генной сети на активность нейронов и т.д.)?

Reply

mozgoved_neo June 6 2011, 15:37:12 UTC
Для моделирования будет использоваться как часть проекта NeuroML(http://www.neuroml.org/), который позволяет строить весьма детальные нейробиологически-обоснованные модели.
Что касается данных для моделирования - один из членов команды также участвует в проекте VirtualWorm(http://caltech.wormbase.org/virtualworm/) - здесь целью является не моделирование динамики системы, а напротив, создание детальной статичной 3D-модели всех внутренних компонентов червя, отдельных клеток и т.д. (основанных на экспериментальных данных), которые, в частности, можно будет загружать и использовать и в составе симулятора OpenWorm.

Reply

combinator30 June 8 2011, 15:19:53 UTC
Спасибо, посмотрю ссылки, потом, может быть, задам ещё вопросы, если они появятся.

Reply

извините за навязчивозть hyppocampus October 5 2011, 15:54:41 UTC
случайно вышел на ваш журнал, может, посоветуете кого)
такой вот дурацкий вопрос:

Нужен хороший специалист по решению задач классификации (дискриминантному анализу, байесовским классификаторам, нейросетям и все такоэ).
Уровень от хорошего аспиранта (в качестве, собственно, аспиранта или научного сотрудника) до доктора наук (поставить задачу нашим математикам, а может, и поделиться своим аспирантом/кандидатом для сотрудничества под хорошую тему).
Задача интересная (построение классификационных моделей, принимающих решение о тех или иных психических характеристиках или эмоциональном состоянии на основании ряда физиологических параметров, в первую очередь, активности мозга (ЭЭГ).
Научный выход ожидается изряден, диссер, в т.ч., докторскую - запросто, так как задача масштабная, статьи во всяких-разных русских и нерусских журналах с высоким импакт-фактором - обязательно, да и деньгами не обидим.
Ежели посоветуете, где их, таких, искать - тоже буду весьма благодарен.

Reply


(The comment has been removed)

mozgoved_neo June 6 2011, 15:41:04 UTC
Основная наша статья еще по CyberElegans Project зависла в журнале Neural Networks. Месяцев 5 с ней никто вообще ничего не делал по вине одного из главных со-редакторов, потом я им написал несколько писем, от нормально-вежливого до гневного, в итоге статью перепоручили другому редактору, сейчас работа разослана рецензентам и вот-вот должны быть результаты. В любом случае, она уже немного устарела и будут новые публикации уже в рамках OpenWorm.

Reply

mozgoved_neo June 6 2011, 15:47:00 UTC
Да, если фокусироваться не на статьях, а непосредственно на результатах работы, прогресс весьма существенный. Задача практически полностью переосмыслена, наша реализация дала возможность задуматься над многими аспектами чтобы реализовать их в новом проекте гораздо более эффективно и обоснованно. В том числе, вместо ПК будет использоваться суперкомпьютер, необходимый как для нового физического симулятора, так и для моделирования структуры и работы нервной системы с высоким разрешением и с учетом нейромедиаторов, типов синапсов, диаметра аксонов, их протяженности и т.д.

Reply

mist1k June 6 2011, 16:01:47 UTC
Интересно пишите. Очень рад за Вас и Вашу деятельность.
Было бы интересно почитать Вашу биографию и путь развития/увлечений, разумеется, если сочтете нужным такое здесь разместить.

Reply


Вопрос из Майами. iilga1 June 6 2011, 18:37:13 UTC
Простите Ваши исследования действительно так важны для науки?

... )

Reply

Re: Вопрос из Майами. mozgoved_neo June 7 2011, 01:50:57 UTC
Подобный случай, как известно, далеко не единственный, время от времени случается, что человек может жить без значительной части мозга, например, без одного полушария, но все-таки это случается относительно редко. Да, можно посвятить свою деятельность изучению аномалий мозга; да, нужно учитывать эти факты, когда мы строим модель нормального мозга; но делать на их основе скоропалительные выводы о важности/полезности всей нейробиологии в целом, на мой взгляд, не стоит.

Именно по той причине, что мозг человека - слишком сложный (хотя и самый заманчивый) объект, чтобы начинать исследование именно с него, мы взялись за гораздо более реальную задачу, связанную с исследованием простейшей нервной системы.

И, кстати, "профессор" - это вполне определенное ученое звание, которому я на данный момент не соответствую. Лучше использовать те термины, значение которых вы знаете и которые адекватно отражают реальность.

Reply


raydac June 6 2011, 19:19:06 UTC
поздравляю с заслуженным выходом на международный уровень! :)

Reply

mozgoved_neo June 7 2011, 01:29:32 UTC
Спасибо!

Reply


mindfie1d June 7 2011, 17:43:14 UTC
поздравляю Андрюха! так держать

Reply

mozgoved_neo June 7 2011, 18:02:20 UTC
Спасибо!

Reply


Leave a comment

Up