Работы Моретто находятся в музеях Франкфурта, Берлина, Лондона, Будапешта, Нью-Йорка, Лос-Анджелеса и др. Картина Аллегория Веры (ок.1530) - в собрании Эрмитажа. Наиболее известна его картина Святая Джустина с донатором и единорогом, находящаяся в Венском музее истории искусств.