Вена: наложение структур
Я пока так и не поняла, что не так с моей молекулой, но научилась перегонять сохраненные вдоль траектории координаты в нормальные колебательные моды, чтобы можно было их проанализировать и попытаться понять, если ли какие-то проблемные. А еще я теперь умею рисовать в VMD изменения молекулы вдоль траектории наложением структур через равные промежутки времени. Цвет выбран в зависимости от момента, и можно оценить, как система эволюционирует. Интересно!
