Наверное, один из самых ценных предметов, который был в институте - это реляционные базы данных. И, к счастью, самая первая моя работа была связана именно с ними.
Мне кажется, что понимание принципов нормализации БД (на хабре есть
статья раскрывающая основной смысл) - это шаг к тому, что при столкновении с любой сложной системой или процессом вы начинаете ее раскладывать на составные части и упорядочивать. В результате вам уже не кажется что-то сложным.
Правда, не забывайте абстрагироваться от задачи. Ведь, по большому счету, построить дом, или сделать сайт, или наладить конвейер по производству упаковок молока - это одно и тоже, только масштаб разный.