Кладистам на заметку
Отрывок из чужой рецензии на чужую статью (подчеркнуто мной):
"Возвращаясь к филогенетическим построениям, автору следует включить в анализ все валидные близкородственные таксоны и использовать метод не максимальной экономии (это общепризнанный источник артефактов, см. Википедию), а максимального подобия (Maximum Likelihood, МП), имеющийся в используемом пакете PAUP (с привлечением опции отношения веса транзиций и трансверсий, например, 2 к 1, когда одна трансверсия стоит двух транзиций), а также байесовское заключение (БЗ), для чего существует много бесплатных приложений, например, MrBayes. При использовании такого подхода деревья обычно конгруэнтны. Для обоих методов ОБЯЗАТЕЛЬНО приводить поддержку ветвей в виде бутстрепа (для МП) и постериорной вероятности (для БЗ)".
"Возвращаясь к филогенетическим построениям, автору следует включить в анализ все валидные близкородственные таксоны и использовать метод не максимальной экономии (это общепризнанный источник артефактов, см. Википедию), а максимального подобия (Maximum Likelihood, МП), имеющийся в используемом пакете PAUP (с привлечением опции отношения веса транзиций и трансверсий, например, 2 к 1, когда одна трансверсия стоит двух транзиций), а также байесовское заключение (БЗ), для чего существует много бесплатных приложений, например, MrBayes. При использовании такого подхода деревья обычно конгруэнтны. Для обоих методов ОБЯЗАТЕЛЬНО приводить поддержку ветвей в виде бутстрепа (для МП) и постериорной вероятности (для БЗ)".