Принято к печати

May 21, 2010 17:22

Многострадальная статья с большим количеством статистики, о которой шла речь здесь: http://trombicula.livejournal.com/77593.html, и здесь: http://trombicula.livejournal.com/78397.html, принята к печати в Systematic Parasitology. Переделка статьи после рецензирования длилась год; за это время у нее появился соавтор - Павел Климов, акаролог из ( Read more... )

манией величия заразился крот, научная практика, клещи-краснотелки, математика

Leave a comment

Comments 5

asafich May 21 2010, 14:14:11 UTC
Поздравляю! Год - это долговато, конечно. Хорошо, что не зря! Я сейчас пребываю в похожей ситуации - получил от рецензентов пендюлей за статистику, выправляю...

Правильно ли я понимаю, что size-correction по Мозиманну - это какой-то хитрый способ нормирования размерных признаков для CVA? Если так, то чем он хорош?

Reply

trombicula May 21 2010, 15:09:05 UTC
Спасибо! Да, долго возился: начал писать еще в январе 2008. В отчетах по грантам эта статья уже чуть не трижды упоминалась - с разным названием, разными авторами... :)

Правильно ли я понимаю, что size-correction по Мозиманну - это какой-то хитрый способ нормирования размерных признаков для CVA? Если так, то чем он хорош?

Хитрости никакой: просто все переменные делятся на геометрическое среднее. (Я как-то уже здесь писал про size-correction по Мозиманну и не по Мозиманну: http://trombicula.livejournal.com/75241.html.) Он годится не только для CVA - скажем, в моей статье и UPGMA-дендрограмма получилась гораздо лучше для size-corrected variables. По сравнению с другими он лучше тем, что согласуется с "геометрическим" представлением о форме, как соотношении промеров.

Что касается CVA, то, конечно, size-correction имеет смысл применять, когда размерная изменчивость в данных действительно велика. Ну, скажем, в нашем случае PC1 объясняла больше 50% изменчивости, причем корреляции 10 из 17 переменных с ней были велики (больше 0.6).

Reply

asafich May 21 2010, 18:00:26 UTC
Спасибо за ссылку про размер и форму: я ее как-то пропустил. Действительно интересно: у меня иногда возникают подобные ситуации (когда PC1 слишком много на себя берет). Буду думать.

Reply


anonymous May 31 2010, 03:12:53 UTC
Cо скриптом к R могу помочь -- это сделать просто, судя по Вашему описанию метода. Если хотите, напишите мне на мейл dactylorhiza на gmail.
===
С уважением,
А. Шипунов

Reply

trombicula May 31 2010, 09:55:28 UTC
Спасибо, написал туда.

Reply


Leave a comment

Up