Программа исследования популяционного иммунитета к SARS-CoV-2 в Moскве

[prof_afv]

Обычно я публикую посты базирующиеся на научных публикациях. Но сегодня решил сделать исключение. Уж больно интересная и многообещающая новость появилась в СМИ - с 16 мая в Москве запускается широкомасштабная программа исследования популяционного иммунитета к SARS-CoV-2. Суть этой программы сводится к определению антител против антигена(ов) SARS-

Comments

[kv_85c]

Испанское исследование не прокомментируете?
https://ria.ru/20200513/1571402815.html
Что-то чувствительность низкая. Похоже, первый вариант, но совсем низкая иммунная прослойка.

[mariianna20]

В разных провинциях количество подтвержденных случаев сильно отличалось. Например в регионе Мадрид 66005 человек, в Барселоне 55464, а в регионе Мурсия 1534 человека на сегодняшний день. Поэтому и % людей с обнаруженными антителами отличается в провинциях. Также как и в России.

[kv_85c]

Я о том, что доля людей с антителами мала везде

[mariianna20]

Да. 2,5 % людей не имевших симптомы и без ПЦР+ только имеют антитела - это очень мало. Интересно какие результаты получат в России. А то многие считают, что уже переболели в декабре-январе, просто не было диагностики. Но исследование в Испании не закончено. Еще не готовы результаты ИФА тестирования. Опубликованы результаты только первого этапа, быстрого теста. И то ,что у 87% с положительным результатом ПЦР обнаружены IgG вызывает вопрос к качеству используемых реагентов на обнаружение антител к SARS-Cov2. Хотя производитель честно сообщает о чувствительности 88%. Будем ждать результатов ИФА тестирования, но мне кажется значительного увеличения % обнаружения IgG не будет. Спасибо за интересную информацию.

[kv_85c]

Лично я это исследование интерпретировал так. Оно проводилось с 27 апреля. Чтобы при низкой чувствительности теста набрать значимый титр IgG, переболеть пациенту надо было три недели назад, плюс инкубационный период. На это время была обнаружена только треть текущего количества случаев болезни. Это уже даёт на сейчас существенно больший популяционный иммунитет в сочетании с летальностью 0,3% где-то, что согласуется с другими исследователями, а не 1,1%, как выведено тут.
Причем есть гипотеза, что летальность падает со временем и мутациями вируса. "Горячих точек" с вымиранием 1-2% населения больше нет, а немецкие исследования показывают снижение количества симптомов при удлинении эпидемической цепочки. Так что не исключаю, что остальные необходимые для набора иммунитета случаи будут проходить на существенно ослабленных штаммах

[prof_afv]

Дайте, пожалуйста, ссылку(и) на публикации о снижении вирулентности при удлинении эпид цепочки

[kv_85c]

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.05.04.20090076v1
В тексте: у заразившихся на стадионе в начале эпидемии в городе Гангельт было в среднем на 1,6 симптома больше, чем у тех, кто там не был. Автор, правда, объясняет вирусной нагрузкой, но корреляция сомнительна, а по длине цепочки очевидна.

[prof_afv]

Спасибо.
Почитаю. Но если оценка вирулентности только по среднему количеству симптомов (каких? одно дело насморк, другое выраженная одышка) выглядит неубедительно. Но надо посмотреть конкретные данные и насколько корректно они получены.

[prof_afv]

Прочитал. Аккуратная работа, в немецком стиле. Никаких доказательств снижения вирулентности я не вижу.

[prof_afv]

Похоже, что доля антитело-положительных в Испании невелика. Во-всяком случае существенно ниже порога для коллективного иммунитета. Приблизительно к такому же выводу пришли и во Франции, используя другой подход (мат моделирование).

Но слишком полагаться на результаты испанского исследование в пересказе ненаучного источника не стоит (пока они не протестируют антитела "нормальными" методами и не опубликуют это в научном формате). Слишком много неизвестных. Была ли выборка случайной? Насколько достоверны результаты тестов на антитела (экспресс-тесты на AT к SARS-CoV-2 имеют "плохую репутацию"? и другие.

Московское исследование, по крайней мере как оно задумано, выглядит существенно более корректным.

[kv_85c]

Вот здесь более научно с приложением отчёта на испанском
https://www.isciii.es/Noticias/Noticias/Paginas/Noticias/PrimerosDatosEstudioENECOVID19.aspx
А о каком французском исследовании идёт речь? Я только вот это https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.18.20071134v1
и это
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.03.22.20040915v4
видел, там доля инфицированных выше на более ранние даты

[prof_afv]

Salje et al., Science 10.1126/science.abc3517
Оценено общее к-во инфицированных, включая бессимптомные случаи. Это позволяет оценить верхнюю границу уровня иммунной прослойки без массового тестирования на АТ(при условии, что допущения заложенные в модель верны)

[prof_afv]

Спасибо. Посмотрю испанские данные внимательно чуть позже. Надёжность метода вызывает сомнения. Но понятно, что до порога коллективного иммунитета далеко.

[mariianna20]

Результаты исследования ENE-COVID19 опубликовало ведомство типа нашего Роспотребнадзора. Они признали. что быстрый тест не является лучшим видом тестирования, но из-за того что люди не хотят сдавать кровь из вены для первого исследования были сделаны rapid тесты. А потом будет ИФА тестирование и математическая обработка результатов полученных двумя тест-системами. Меня впечатлило как сделана выборка людей для исследования. Сколько критериев учтено. Будем ждать окончательных результатов. Документ называется ESTUDIO ENE-COVID19: PRIMERA RONDA
ESTUDIO NACIONAL DE SERO-EPIDEMIOLOGÍA DE
LA INFECCIÓN POR SARS-COV-2 EN ESPAÑA
INFORME PRELIMINAR 13 DE MAYO DE 2020