Задумався сильно - за останні два тижні розробив і придумав два методи , різного еволюційно-філогенетичного керунку. І ось тепер думаю - ділитися з шефом і потім , разом з ним писати статті і подавати чи самому. Проблема в тому, що за пару тижнів мене з цим інстом нічого не зв’язує...
задумався

Після того як фатерлянд виграв в порто , можна щось пописати біоінформатичне в жж ( Read more... )

Отже зараз троха біоінформатики, або краще сказати теоретичної біології - так як насправді біоінформатика являється частиною теоретичною біології, і застосування її методів досить обмежено. Але зараз розкажу про мій проект з моделювання мінімального стрептоміцетного генома ( Read more... )

Сьогодні остаточно дізнався свої напрямки роботи - себто проекти ( Read more... )

Недавно в мене виникла потреба написати власний пакунок в R. Скачав епічний мануал, по створенню таких штук - він виявився на 148 сторінок. Дуже довго читав і розбирався. І в результаті вияснив як це робиться. Отже для цього нам треба використовувати стандартний пакунок package.skeleton() , який і дозволяє це зробити ( Read more... )

Фолат-залежні процеси (ФОЗП) - це група реакцій для яких кофакторами виступають похідні фолієвої кислоти різного ступеня окисленості ( Read more... )

 В 1984 Papoutsakis et al, [1984] використав метод балансу стаціонарних метаболічних потоків для побудови математичної моделі метаболізму Clostridium acetobutylicum. Побудована модель включала в себе 14 реакцій, кількісно описувала ріст біомаси мікроорганізмів на глюкозі, і ці кількісні характеристики співпадали з тими, що були отримані в ( Read more... )

 Стехіометричні моделі є розвитком структурних моделей. Параметрами моделі є стехіометричні коефіцієнти метаболічних реакцій, що є добре відомими в наш час. Модель метаболізму являє собою систему лінійних алгебраїчних рівнянь, де в ролі змінних виступають швидкості метаболічних реакцій у стаціонарному стані системи. Стехіометричні моделі, окрім ( Read more... )

 Структурні моделі описують систему біохімічних реакцій як мережу, у якій наявні елементи і зв’язки між цими елементами. Вузлами можуть виступати метаболіти, а лініями зв’язку між вузлами - реакції, що залучають ці метаболіти, або навпаки, можна розглядати реакції, як вузли мережі, а метаболіти - як зв’язуючі ланки між ними . Структурна модель не ( Read more... )

Я ніколи не міг подумати , що в україні можлива така конфа!то взагалі
понад 70 профів з європи та сша, будуть доповідати з молекулярних методів моделювання в біології!!!!
там один чувак  доповідає прямо по методах мого диплому!
але я в ті дні зайнятий
Благо орги мої знайомі

http://xray.isc.kharkov.com/MACC-4/index.php?p=u