1. Получаем хэш-код коммита, к которому хотим вернуться.
2. Заходим в папку репозитория и пишем в консоль:
  $ git reset --hard a3775a5485af0af20375cedf46112db5f813322a
  $ git push --force ( Read more... )

Для git'ового репозитория отключение слежения за правами

в репозитории:
git config core.filemode false

в общем:
git config --global core.filemode false

взято отсюда

https://github.com/Gizra/KnowledgeBase/wiki/How-to-set-Git-to-ignore-chmod ( Read more... )