Новые геномы из французского мезолита
Погребение на острове Тевьек, Франция
Появился анонс новой статьи, где будут мезолититическе геномы из Франции. Пока, к сожалению, даже препринта нет, только аннотация.
"С раннего голоцена Западная и Центральная Европа была заселена генетически отличной группой западных охотников-собирателей (WHG). Эти группы в конечном итоге были заменены и ассимилированы прибывшими неолитическими фермерами. Побережье Атлантике было домом для некоторых из последних мезолитических памятников материковой Европы, представленных культовыми памятниками под открытым небом в Оэдике и Тевьеке на юге Бретани, Франция. Эти памятники известны необычайно хорошо сохранившимися и богатыми захоронениями. Геномные исследования мезолитических европейских охотников-собирателей были ограничены одной или несколькими особями на памятник, и наше понимание социальной динамики последних мезолитических охотников-собирателей Европы и их взаимодействия с прибывшими земледельцами ограничено. Мы секвенировали и проанализировали полные геномы 10 человек из стоянок позднего мезолита в Ходике, Тевьеке и Шампиньи во Франции, четыре из которых были секвенированы с охватом генома от 23 до 8 раз. Анализ геномных, хронологических и диетических данных показал, что население позднего мезолита в Бретани сохраняло отдельные социальные единицы внутри сети обмена партнерами. Это привело к низкому биологическому родству внутри группы, что препятствовало кровнородственному спариванию, несмотря на небольшую численность населения групп позднего мезолита. Мы не обнаружили генетического происхождения от неолитических земледельцев у проанализированных охотников-собирателей, хотя некоторые из них, возможно, сосуществовали с первыми земледельческими группами в соседних регионах. Следовательно, вопреки предыдущим выводам, основанным на данных о стабильных изотопах из тех же мест, сообщество собирателей позднего мезолита было ограничено в обмене партнерами с соседними группами охотников-собирателей, исключая неолитических земледельцев."
Несмотря на то, что препринта еще нет, сами образцы уже выложены в Европейский нуклеотидный архив.
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB71770
По ним уже сделаны G25 координаты. И мы можем посмотреть, что это были за охотники. Сравнивать их с современным людьми особого смысла нет, а вот сравнить с древними образцами, а также прогнать через калькулятор древних групп мы их можем. Кроме того, известны их однородительские маркеры.
Sample_name Hg Hg_marker Total_reads Valid_markers
hoe001 NA 13227633 479
hoe002 I-Y3104*(xL621,L161) S7721;Z2589;etc. 325651200 94608
hoe003 I-Y3104*(xL621,L161) YP202;Y3109;etc. 2137673885 128055
hoe004 ? R-L52 CTS7650 402728620 14992
hoe005 ? R-L52 CTS7650 652343679 18903
hoe006 NA 2267412 11
stp001 I-CTS616*(xCTS10057) CTS9139;CTS11271;etc. 1021738494 127816
tev001 I-L460*(xM436) AM00522;Y8776 250203247 61589
tev002 ? A1*(xA1a) Y9619;YP3891 21552051 1717
tev003 I-Y3104*(xL621,L161) Z2585;YP212;etc. 2066566932 128063
А теперь к сравнению с древними образцами.
Для начала образцы из Оэдика. В литературе встречается масса напиисаний этого острова на русском. И Оэдик, и Гоэдик, и Хоэдик. Правильно, наверное, вообще Эйдик. Этот мезолитический памятник довольно известен. В ЖЖ у меня тоже фигурировал несколько раз в разных контекстах (изотопы, палеоантропология). Оттуда доступно пять образцов. Как можно увидеть, они сходны между собой, а также с западноевропейскими охотниками-собирателями. В первую десятку попали древние охотники из Италии, Англии, Ирландии, Люксембурга, Германии.
Далее - три образца из Тевьека (тоже известное) и один из Шампиньи (?). Здесь мы видим ту же ситуацию. В целом, все образцы близки друг к другу и к классическим WHG.
Теперь можно прогнать эти образцы через один из моих калькуляторов, сделанных специально для мезо-неолитических групп. Как можно заметить, эти индивиды состоят из разных региональных компонентов WHG. Остальные компоненты минимальны, и их можно рассматривать как информационный шум.
