Random drift of HIV populations in culture

Mar 25, 2009 13:20

Пока я тут на лыжах катаюсь, у меня статья вышла: Random drift of HIV populations in culture. Она в свободном доступе, так что читайте ( Read more... )

hiv, работа, эволюция

Leave a comment

Comments 57

anatol_olegych March 25 2009, 21:19:22 UTC
Красивая работа. И Журнал Плоской Генетики xороший. Поздравляю.

Reply

shvarz March 26 2009, 03:38:13 UTC
Спасибо :)

Reply


terrink March 25 2009, 21:50:54 UTC
Поздравляю!
Кстати, когда-то давно вы давали ссылку на работу по HIV - там человека вылечили пересадкой клеток КМ от донора с гомозиготной делецией в CCR5. Я тогда писала в комментах, что забавно было бы получить стволовые клетки с этой делецией.
Линий СК с делецией в гетерозиготе я, пошарив в закромах, нашла уже пару десятков. Есть шанс, что и гомозигота найдется. Так вот вопрос - а кто из исследователей был бы в таких линиях заинтересован?

Reply

shvarz March 26 2009, 03:40:08 UTC
Не знаю. Зачем они? Они же по определению подойдут только тому, из кого их взяли. Или я чего-то не понимаю?

Reply

terrink March 26 2009, 03:59:04 UTC
Не, ну почему - только тому. Совместимым реципиентам тоже. По идее, можно создать банк стволовых клеток, устойчивых к ВИЧ, для лечения больных СПИДом, по аналогии с базой данных доноров костного мозга - для людей с заболеваниями крови.

Reply

shvarz March 26 2009, 04:12:40 UTC
Хм, по-идее действительно можно. Но мужику ведь его собственную иммунную систему снесли напрочь, прежде чем эти стволовые подсаживать. Сомневаюсь, что кто-то согласится на это, имея HAART как альтернативу. Разве что редкие случаи для которых HAART не работает... Наверно можно такое организовать. К кому обратиться, правда, понятия не имею :(

Reply


artemn March 25 2009, 22:17:29 UTC
Хорошая статья, вы молодец конечно... :)

А что вы понимаете под "идеальной" популяцией, разница с которой в "количестве генетического дрифта" остается в 3 раза, если даже "инфекцию синхронизировать"?

Reply

shvarz March 26 2009, 03:42:57 UTC
Спасибо.
Идеальная популяция в данном случае равнозначна мешку с шарами разных цветов. Есть более серьезные и формальные определения, но в данном случае эта аналогия вполне подходит.

Reply

artemn March 26 2009, 03:47:26 UTC
Тогда я не очень понимаю, почему надо искать объяснение разницы в 3 раза. Так как неидеальная популяция (вирусы в вашем случае) точно не мешок с шарами.

(филосовское отступление: ваш мешок с шарами такой, что шары вынимаются одновременно, если добавить "непрерывность" времени, то уже появится математически множитель 2).

Reply

shvarz March 26 2009, 03:52:21 UTC
Ну, собственно чтобы понять, чем она отличается от мешка с шарами. Так уж устроены ученые - все им надо знать. И не почему-либо, а "просто так" :)

Про множитель 2 - это интересно. Откуда это? Вообще в поп.генетике обычно моделируют дискретные поколения (шары вынимаются одновременно), к уровнениям переходят только если очень надо :)

Reply


worldtensor March 25 2009, 22:33:26 UTC
А почему такого ускорения генетического дрифта не происходит с другими вирусами?

Reply

anatol_olegych March 25 2009, 23:43:27 UTC
Кстати, да -- что происxодит с другими вирусами? Да и любыми инфекционными агентами, которые долго сидят...

Reply

shvarz March 26 2009, 03:48:01 UTC
anatol_olegych March 26 2009, 04:43:51 UTC
Сидят, в смысле имеют возможность для дрейфа: наxодятся в организме xозяина много поколений.

Reply


yakushima March 26 2009, 02:21:23 UTC
Молодец! Так держать:)

Reply

shvarz March 26 2009, 03:48:47 UTC
Держать уже нечего, все отпало :)
Как там вазелин, пригодился?

Reply


Leave a comment

Up