Leave a comment

Comments 13

vigna June 1 2014, 20:29:38 UTC
По поводу 1000-долларового генома и вообще удешевления секвенирования есть и вот такое мнение: http://biomickwatson.wordpress.com/2014/01/27/the-de-democratization-of-sequencing/
и с ним трудно не согласиться.

Reply

scienceblogger June 2 2014, 05:08:41 UTC
Согласен. Но, по странному стечению обстоятельств, медики подтягивают к этому делу сиквенсы опухолей. Вотпрямсчас в Британии проводят клинику подбора терапии РПЖ по геному. А при распространенности онкологии...

Заговор, заговор! :-)

Reply

dundee_scalaer June 7 2014, 09:33:52 UTC
А зачем вам сиквенатор в лаборатории? В большестве даже крупных университетов Британии их нет. Сиквенирование делается по заказу в стороннeй компании. Да он (сиквенатор) в маленькой лаборатории и не нужен. Простаивать будет большую часть времени. У вас может уйти несколько месяцев на обработку и интерпретацию результатов одного эксперимента с такой машины. Стоимость секвинирование DNA с разумной глубиной или RNA-seq - порядка нескольких сотен фунтов. На обычный грант можно 2-3 штуки в год заказывать.

Reply

vigna June 7 2014, 11:50:38 UTC
Ой, не смешите меня :)

Reply


dundee_scalaer June 7 2014, 09:41:17 UTC
"Теперь, когда секвенирование становится по-настоящему дешевым, можно начинать говорить о сканировании полных геномов отдельных пациентов, ну или по крайней мере тех его областей, которые кодируют белки. "

23andMe делает сиквенирование экзома (тех его областей, которые кодируют белки) для любого желающего за $99 уже пару-тройку лет как. До прошлого года они давали разнообразные медицинские предсказания по этим данным, но им запретили. Теперь только дают "ancestry-related genetic reports" и сырые данные.

К сожалению, в Росии сие не доступно из-за ограничений по вывозу биологических образцов за границу.

Reply

vigna June 7 2014, 11:53:57 UTC
23andMe делает сиквенирование экзома (тех его областей, которые кодируют белки) для любого желающего за $99 уже пару-тройку лет как.

Всё-таки решили посмешить, ОК.
За 99 они делают генотипирование на микрочипах, что позволяет найти только известные варианты, да и то с не очень большой точностью. А секвенирование экзома они делают за 999: https://www.23andme.com/exome/

Reply

dundee_scalaer June 7 2014, 12:04:56 UTC
Извените, с девятками ошибся.

Reply


Leave a comment

Up