Вопрос по Коронавирусу

[agasfer]

Или я туплю, или чего-то пропустил. Если, с одной стороны, сиквенс генома нового коронавируса (2019-nCoV) был опубликован только 30 января, а с другой стороны, порядка 8.5% всех простуд вызвано коронавирусами, (или от 15% до 30%, по другим данным), то что же такое тестировали раньше и чем

Comments

[lj_frank_bot]

Hello!
LiveJournal categorization system detected that your entry belongs to the category: Медицина.
If you think that this choice was wrong please reply this comment. Your feedback will help us improve system.
Frank,
LJ Team

[agasfer]

Да

[lj_frank_bot]

Супер

[mary_spiri]

Диагностика это ПЦР, причем в сочетании с обратной транскрипцией, вирус РНКовый. Опубликовали в январе полный геном. А для диагностики по ПЦР достаточно куска любого гена примерно в 100 нуклеотидов. Такой кусок наверняка получили практически сразу, используя общие праймеры для амплификации обычных коронавирусов.

А дальше можно либо сделать специфический тест на новый кусок, не там, где общие праймеры, а используя специфическую часть. Либо можно продолжать использовать общие праймеры для амплификации, а полученный куски ДНК секвенировать, чтобы увидеть в точности, что там за вирус. И тот и другой метод будут весьма четко отличать старых вирусов от новых. Как бывший вирусолог, я думаю, что первые месяцы шли вторым путем. А сейчас потихоньку переходят на первый путь с ПЦР на конкретный вирус и специфический праймеры.

[agasfer]

Это все мне понятно, но те цифры, которые давал Китай, США и др страны о числе заболевших--мы не знаем наверняка, на чем они основаны.

[mary_spiri]

Ответ на этот вопрос мы вряд ли получим. Хотя думаю, что они все же секвенировали, иначе вообще смысла нет.

[agasfer]

Вопрос--когда?

Поскольку простуду вызывают несколько подтипов коронавирусов, скорее всего, изначальный ПЦР тест был привязан к консервативному участку. Следовательно, если результаты были положительные, то факт новизны был заподозрен не сразу. Ну а секвенировать инвариабельный участок толку мало.

Черновой вариант генома китайцы еще в начале января опубликовали, оказывается, поэтому CDC и сработало так быстро.

[phoenix2100]

Куда уж выше - один умерший на 4 выздоровевших.

[agasfer]

Для MERS ВОЗ давали 34.4-37.2%.

[i_delyagin]

А я вообще считаю, летальность будет 80%.

[irbis_s]

Там реальная летальность примерно от 5% до 10%, если корректно считать. Полно народа, которые уже не умрут, но еще не выписаны, поэтому пока не входят в официальную статистику.