Компания была основана в 2005 году в результате реорганизации холдинга РАО ЕЭС. Вновь созданная компания объединила 5 электростанций. Первоначально энергокомпания носила название ОАО «Четвёртая генерирующая компания оптового рынка электроэнергии» (или сокращенно - «ОГК-4»). Но в 2011 году владельцы компании - концерн E.ON, изменили название на ОАО «Э.ОН Россия» (JSC E.ON Russia). На сегодняшний день E.ON - крупнейший иностранный инвестор в электроэнергетику России. Общие вложения концерна E.ON в электроэнергетику России до 2015 г. составляют 6,1 млрд. евро (224 млрд. рублей).
В настоящий момент в результате реализации инвестиционной программы строительства новых мощностей и программы модернизации общая установленная мощность Э.OН Россия составляет 10 345 МВт. В 2014 году электростанции Э.ОН Россия выработали 59 тыс. 238 млн кВт.ч. Более 60% объема производства приходится на Сургутскую ГРЭС-2.