Особенности транс-пар
После того, как транс пары в составе параллельных двойных спиралей ДНК стали реальностью, возник новый уровень логических альтернатив. Как вы помните, у цис АТ и GC пар локальная ориентация сахара могла либо соответствовать глобальному направлению сахарофосфатного остова, либо быть противоположной ему.
В Z-DNA локальное противоречило глобальному, к тому же, для соединения Z-DNA и B-DNA одну переходную пару оснований нужно было выпетлить, потому что малые бороздки там и там были по разную сторону. У транс АТ пары бороздки одинаковые и сахара в норме параллельны. Если же повернуть один на 180 градусов, возникнет такое же противоречие глобального и локального. Вопрос, может ли быть антипараллельная ДНК с такой транс-парой, т.е., антипараллельная ДНК с локально-параллельными структурными единицами? Поскольку в Z-DNA локально-параллельные единицы соединились в глобально-антипараллельную структуру, возможна ли левоспиральная антипараллельная ДНК с транс парами? А как насчет лево-спиральной параллельной ДНК с транс парами?
Эти логические предпосылки составили концептуальную основу для моделирования целого семейства новых структур ДНК.
И если раньше, когда первые признаки торжества идеи стали отчетливо проступать, я обращался, например, к С.Ш., чтобы он набил перфокарты, построил и посчитал энергии для моделей ДНК, то на E&S workstation всё это можно было делать визуально и интерактивно и в любое время дня и ночи самому. Потому что вахтерш не было, и на заявках на работу в выходные и внеурочное время намерения не остужались. Был ключ в кармане, которым отпиралось здание и любая дверь в отделе. К тому же, это стало моим официальным занятием, и за него платили бешеные по тем временам деньги. Из которых бóльшая часть уходила на оплату жилья.
За этой workstation я набрал свои 20 тысяч часов. В отличие от Битлов, вся моя музыка сочинялась на трех аккордах.
В Z-DNA локальное противоречило глобальному, к тому же, для соединения Z-DNA и B-DNA одну переходную пару оснований нужно было выпетлить, потому что малые бороздки там и там были по разную сторону. У транс АТ пары бороздки одинаковые и сахара в норме параллельны. Если же повернуть один на 180 градусов, возникнет такое же противоречие глобального и локального. Вопрос, может ли быть антипараллельная ДНК с такой транс-парой, т.е., антипараллельная ДНК с локально-параллельными структурными единицами? Поскольку в Z-DNA локально-параллельные единицы соединились в глобально-антипараллельную структуру, возможна ли левоспиральная антипараллельная ДНК с транс парами? А как насчет лево-спиральной параллельной ДНК с транс парами?
Эти логические предпосылки составили концептуальную основу для моделирования целого семейства новых структур ДНК.
И если раньше, когда первые признаки торжества идеи стали отчетливо проступать, я обращался, например, к С.Ш., чтобы он набил перфокарты, построил и посчитал энергии для моделей ДНК, то на E&S workstation всё это можно было делать визуально и интерактивно и в любое время дня и ночи самому. Потому что вахтерш не было, и на заявках на работу в выходные и внеурочное время намерения не остужались. Был ключ в кармане, которым отпиралось здание и любая дверь в отделе. К тому же, это стало моим официальным занятием, и за него платили бешеные по тем временам деньги. Из которых бóльшая часть уходила на оплату жилья.
За этой workstation я набрал свои 20 тысяч часов. В отличие от Битлов, вся моя музыка сочинялась на трех аккордах.