К теме рекомбинации на параллельных ДНК
я возвращался периодически вдоль всей карьеры занятости необычными структурами ДНК. Каждый раз, когда, казалось, были созданы физические объекты для изложения новых, связанных с новыми структурами возможностей, возникала потребность в математике и резком уходе от структур самих по себе к разработке последствий. С которыми, как с неоконченным портретом Моны Лизы, я повсюду путешествую.
В таких точках по-прежнему возникали непонимания средой моих устремлений. Потому что под музыку: локальные отклонения от двойной спирали Watson-Crick могут привести к развитию болезней или иметь особую роль в регуляции транскрипции, а паче приводить к нарушениям репликации ДНК, можно вполне было получать гранты. Особенно, если эти которые регуляторы транскрипции стабилизировать маленькой молекулой.
Ситуация как в юности: все занимаются деталями знакомого: как эта двойная спираль гнется, какие у неё локальные отличия в шагах и степень закрутки на разных последовательностях. Надежно, солидно. И очень мелко. Невдохновительно. Нежаждоутоляюще. Вдохновительно - время Крика, когда создавалась настоящая наука, без больших реверансов в направление болезней. Если болезни и захватывались в оборот - так только для блистательного объяснения их механизма вновь создаваемой наукой. Создавались сами понятия: Транскрипция, Репликация, Центральная Догма.
Случайно наткнулся на рисунок в NAR, Survey and Summary 2014 года, напомнивший мой, с рекомбинацией на параллельных нитях à la Möbius strip. Подпись под рисунком симпатичная:
Figure 3. Model of viral RNA:RNA dimerization and recombination involving a pair of monomeric G4s mediated by a synaptic dimericG4 intermediate [inspired and adapted from a model of intergenic recombination (115)]. (a) A pair of parallel-stranded monomeric G4s. (b) NCp7 chaperon properties favor formation of an inter-RNA synaptic intermediate involving a parallel-stranded dimericG4. Cleavage, rotation and subsequent rejoining are mediated by a potential, undefined nuclease-topoisomerase-like enzyme complex. (c) Following dimerization and/or recombination, NCp7 annealing properties favor formation of a new pair of parallel-stranded monomeric G4s.
особенно эта часть:
[inspired and adapted from a model of intergenic recombination (115)].
А вот и моя процитированная (115) "Вдохновляющая модель":
И, чтобы уж два раза не. Нет, впрочем - тема отдельного рассмотрения, о чем я было собрался не вставать. И не встану.
Разве что за кофе: Надо кончить статью для повторной подачи с ответами на вопросы от пяти (!) рецензентов. Так и чешется рассказать и эту историю, но нельзя. До тех пор пока вопрос с публикацией не решен.
В таких точках по-прежнему возникали непонимания средой моих устремлений. Потому что под музыку: локальные отклонения от двойной спирали Watson-Crick могут привести к развитию болезней или иметь особую роль в регуляции транскрипции, а паче приводить к нарушениям репликации ДНК, можно вполне было получать гранты. Особенно, если эти которые регуляторы транскрипции стабилизировать маленькой молекулой.
Ситуация как в юности: все занимаются деталями знакомого: как эта двойная спираль гнется, какие у неё локальные отличия в шагах и степень закрутки на разных последовательностях. Надежно, солидно. И очень мелко. Невдохновительно. Нежаждоутоляюще. Вдохновительно - время Крика, когда создавалась настоящая наука, без больших реверансов в направление болезней. Если болезни и захватывались в оборот - так только для блистательного объяснения их механизма вновь создаваемой наукой. Создавались сами понятия: Транскрипция, Репликация, Центральная Догма.
Случайно наткнулся на рисунок в NAR, Survey and Summary 2014 года, напомнивший мой, с рекомбинацией на параллельных нитях à la Möbius strip. Подпись под рисунком симпатичная:
Figure 3. Model of viral RNA:RNA dimerization and recombination involving a pair of monomeric G4s mediated by a synaptic dimericG4 intermediate [inspired and adapted from a model of intergenic recombination (115)]. (a) A pair of parallel-stranded monomeric G4s. (b) NCp7 chaperon properties favor formation of an inter-RNA synaptic intermediate involving a parallel-stranded dimericG4. Cleavage, rotation and subsequent rejoining are mediated by a potential, undefined nuclease-topoisomerase-like enzyme complex. (c) Following dimerization and/or recombination, NCp7 annealing properties favor formation of a new pair of parallel-stranded monomeric G4s.
особенно эта часть:
[inspired and adapted from a model of intergenic recombination (115)].
А вот и моя процитированная (115) "Вдохновляющая модель":
И, чтобы уж два раза не. Нет, впрочем - тема отдельного рассмотрения, о чем я было собрался не вставать. И не встану.
Разве что за кофе: Надо кончить статью для повторной подачи с ответами на вопросы от пяти (!) рецензентов. Так и чешется рассказать и эту историю, но нельзя. До тех пор пока вопрос с публикацией не решен.