Монастырь расположен в посёлке Некрасовское Ярославской области у впадения реки Солоницы в Волгу. Монастырь был основан в 15 веке. Сейчас монастырь находится в весьма плачевном состоянии, ведутся реставрационные работы, сохранившиеся здания были построены в 19 веке. Причиной основания послужило обретение здесь в 14 веке иконы Николая Чудотворца, приплывшей на одной из бабаек. Первоначально икона была помещена в дубовой роще к югу от будущего монастыря. В 1719 году в монастыре случился серьёзный пожар; сгорела большая часть монастырского имущества и архива. В 1764 году, согласно манифесту Екатерины Второй, причислен к сверхштатным.
В Николо-Бабайском монастыре неоднократно бывал Николай Некрасов, чьё детство прошло неподалёку, на противоположном берегу Волги - в сельце Грешнево. Монастырь упомянут поэтом в стихотворении «Горе старого Наума» ″Вблизи - Бабайский монастырь, село Большие Соли…″
В 1919 году монастырь был упразднён советской властью, тогда был уничтожен уникальный храм (Иверский храм) взорвать его удалось только с третьего раза и колокольня. Монастырь был возрождён в 1998 году. Сейчас на месте того храма стоит новодел даже не похожий на оригинал, а на месте колокольни сейчас стоит тоже новодельный деревянный храм.
Вид на Николо-Бабаевский монастырь с Волги
Возле монастыря на берегу волги расположен источник солёной минеральной воды, вода в нём не питьевая, уж больно солёная, количество соли в этом источнике достигает 100г на 1л воды.