Заметки издалека-3. Чем я тут занимаюсь
4:30pm по сиднейскому времени. Сижу в номере. Можно было бы и поработать (о, этого добра у меня много - не на одну жизнь хватит), однако же дальше этой мысли дело не идёт. И всю неделю так - вроде вечерами не надо бежать с Иваном на тренировку, готовить ужин, кормить собак и пр. и пр., а всё равно не могу заставить себя заниматься чем-то более продуктивным, нежели смотреть Зумбо-Десерты или строчить в ЖЖ. Видимо, активность моего мозга привыкла снижаться к вечеру, вот и результат.
Всё, что планировали сделать за эту недельную поездку - сделали. Даже немного больше. Однако, вопросов меньше не стало. В науке всегда так - чем больше изучаешь, тем больше вопросов. А раз есть вопросы, нужно искать на них ответы - и так по кругу.
Расскажу в двух словах, чем мы всю неделю занимались.
Огромный национальный проект, призванный изучить молекулярные аспекты когнитивного старения (проекту уже больше 13 лет), собрал фенотипную информацию и много крови (для разных целей) с более 1000 человек возрастом старше 65. Моя роль в этом проекте - сгенерировать данные траскриптома этих людей и изучить его относительно старческой депрессии (транскриптом - это экспрессия генома). За 2 года управилась. Решили усложнить задачу и посмотреть как геном связан с транскриптомом на уровне индивидуальной нуклеотидной пары, т.е. мы хотим знать какие индивидуальные нуклеотидные полиморфизмы в геноме влияют на экспрессию того или иного гена. Это даст нам возможность с большей точностью определить молекулярные механизмы того или иного явления (например, старческой депрессии в моём случае), а это, в свою очередь позволит приблизиться к биологическим маркерам и, возможно, подскажет на что опираться при разработке новых терапевтических препаратов. Так вот, всю неделю мы, используя биоинформатические методы, соединяли геном с транскриптомом. Соединили. Однако, ещё много нужно сделать, чтобы понять, что эти сотни ассоциаций означают в биологическом смысле.
Но над этим я начну думать не раньше... 6 часов вечера, потому что в 6 часов мы, трое узников биоинформатики, идём чего-нибудь выпить и закусить. А заодно отметить успешное окончание (относительное окончание) недельного проекта под названием "Лилиана в Сиднее" так ничего и не увидела.
Всё, что планировали сделать за эту недельную поездку - сделали. Даже немного больше. Однако, вопросов меньше не стало. В науке всегда так - чем больше изучаешь, тем больше вопросов. А раз есть вопросы, нужно искать на них ответы - и так по кругу.
Расскажу в двух словах, чем мы всю неделю занимались.
Огромный национальный проект, призванный изучить молекулярные аспекты когнитивного старения (проекту уже больше 13 лет), собрал фенотипную информацию и много крови (для разных целей) с более 1000 человек возрастом старше 65. Моя роль в этом проекте - сгенерировать данные траскриптома этих людей и изучить его относительно старческой депрессии (транскриптом - это экспрессия генома). За 2 года управилась. Решили усложнить задачу и посмотреть как геном связан с транскриптомом на уровне индивидуальной нуклеотидной пары, т.е. мы хотим знать какие индивидуальные нуклеотидные полиморфизмы в геноме влияют на экспрессию того или иного гена. Это даст нам возможность с большей точностью определить молекулярные механизмы того или иного явления (например, старческой депрессии в моём случае), а это, в свою очередь позволит приблизиться к биологическим маркерам и, возможно, подскажет на что опираться при разработке новых терапевтических препаратов. Так вот, всю неделю мы, используя биоинформатические методы, соединяли геном с транскриптомом. Соединили. Однако, ещё много нужно сделать, чтобы понять, что эти сотни ассоциаций означают в биологическом смысле.
Но над этим я начну думать не раньше... 6 часов вечера, потому что в 6 часов мы, трое узников биоинформатики, идём чего-нибудь выпить и закусить. А заодно отметить успешное окончание (относительное окончание) недельного проекта под названием "Лилиана в Сиднее" так ничего и не увидела.