Возможное объяснение распространения дельты

[shvarz]

Viral infection and transmission in a large well-traced outbreak caused by the Delta SARS-CoV-2 variant

Препринт, о котором я узнал из TWIV. Уже много раз рекомендовал этот подкаст, и еще раз порекомендую. Обычные эпизоды в нем довольно длинные и насыщенные наукой, но у них также есть еженедельные выпуски с Дэниелом Гриффином, врачем в НЙ, и эти

Comments

[vba_]

Надо, конечно, смотреть динамику, первый тест интересен, но динамика и максимальные значения должны ответить на вопрос - дает ли дельта в среднем большее число вирусных частиц при развитии заболевания (например, потому что интенсивность репликаций выше, оттого и инкубационный период короче).

[shvarz]

Если симптомы наступают примерно в такой же динамике как у исходного вируса (а говорят что вроде бы это так), то это существенно увеличивает период бессимптомной заразности и "площадь под кривой" не так важна. Она может даже меньше быть у дельты.

[vba_]

Нет, инкубационный период у дельты существенно короче.

In a preprint posted 12 July, the researchers report that virus was first detectable in people with the Delta variant four days after exposure,compared with an average of six days among people with the original strain, suggesting that Delta replicates much faster. Individuals infected with Delta also had viral loads up to 1,260 times higher than those in people infected with the original strain.

The combination of a high number of viruses and a short incubation period makes sense as an explanation for Delta’s heightened transmissibility, says epidemiologist Benjamin Cowling at the University of Hong Kong. The sheer amount of virus in the respiratory tract means that superspreading events are likely to infect even more people, and that people might begin spreading the virus earlier after they become infected.
https://www.nature.com/articles/d41586-021-01986-w

[shvarz]

Так это вы сослались на популярное описание той самой статьи о которой этот пост.
Инкубационный период все-таки считается до появления симптомов, а положительный тест ПЦР - это не симптом.

[vba_]

Да, это я знаю.
Поэтому я добавил второй параграф из обзора в Nature, где говорится именно об инкубационном периоде. Он на другой странице и не относится к препринту, о котором вы рассказываете.

Ну и китайцы говорят то же самое.
Во Франции тоже оценили инкубационный период дельты (до появления симптомов), он короче.

[vba_]

Впрочем, надо мне уточнить, потому что большая путаница - разные источники ссылаются на китайские исследования (откуда и препринт), но некоторые говорят про PCR, а другие - про инкубационный период.
Посмотрю внимательнее.

[vba_]

Да, надо сказать, этот препринт поднял много пыли. Теперь масса сайтов ссылается на него в качестве доказательства того, что инкубационный период у дельты короче. В принципе, более быстрый рост вирусной нагрузки и должен давать более короткий инкубационный период (странно, если бы было по-другому), но в препринте не оценивали время появления симптомов.

Вот обычное рассуждение, которое трудно опровергнуть (выделено мной):

The time from exposure to the first positive PCR test was also shorter with Delta, at 4 days compared with 6 days.

This all suggests a faster replication rate, a reduced incubation period, and greater viral shedding -- all factors that contribute to Delta's increased infectiousness and transmissibility

[shvarz]

Вот для этого и нужен жж :)
Я согласен, что эти данные позволяют suggest укороченный инкубационный период. Они также позволяют suggest что гораздо худший вариант, при котором инкубационный период не укорочен, но заразным человек становится раньше.