Белок S

[shvarz]

Предыдущий выпуск закончился выкладыванием геномной последовательности нового коронавируса в публичные базы данных. А продолжаем мы с того, как эта последовательность может быть использована.

Статья: SARS-CoV-2 Cell Entry Depends on ACE2 and TMPRSS2 and Is Blocked by a Clinically Proven Protease Inhibitor

Comments

[simonff]

Офигительный прогресс, надо сказать. Спасибо за детальные объяснения.

А не можете посоветовать подобного рода текст на английском? Хотелось бы коллегам показать.

[e_clair]

Так ведь дана же ссылка на эту статью в Cell.

[simonff]

Статью трудновато читать для неспециалиста, а shvarz прекрасно объясняет контекст.

[shvarz]

Есть отличный подкаст This Week in Virology. Там обычно все так детально не разжевывают, но они с удовольствием отвечают на любые вопросы. У главного мужика там еть блог: http://www.virology.ws/ Попробуйте его.

[zlata_gl]

Уважаемый Егор !
А можно вопрос от блондинки ?
Ваши прогнозы на
-появление приличных лекарств
-появление вакцин
-самое главное - появление хороших и быстрых тестов.
Сейчас всех "подозреваемых" заставляют сидеть 2 недели в карантине.
Тест, который сократил БЫ этот срок (хотя бы в 2-3 раза), дал БЫ многомиллиардный экономический эффект.

[shvarz]

Вакцина - года полтора-два.
Лекраства - очень трудно предсказать, но если повезет и сработает какое-нибудь из уже используемых для других целей, то месяцев шесть. Если с нуля - то год.
Еще делают антитела, которые можно будет использовать для лечения. Для них с полгода, но они будут куда дороже обычных лекарств.

Все это исходя из того, что все отлично сработает с первого/второго захода. И это время на разработку, до массового применения надо еще прибавить сколько-то времени, скажем с полгода-год в зависимости от разных факторов.

[rrr2]

Вы цитировали врача из штата Вашингтон про off label ремдезивир:

Remdesivir might work, some hosps have seen improvement with it quite rapidly, marked improvement in 1-3 days. ARDS trajectory is impressive with it, pts improve much more rapidly than expected in usual ARDS.
*Recommended course is 10d, but due to scarcity all hosps have stopped it when pt clinically out of the woods

Нельзя ли, к примеру, произвести его побольше, чтобы не было scarcity? Применяют ли его в Италии, интересно?

[shvarz]

Можно, конечно, но даже это займет какое-то время. Производство клинических препаратов производится в специальных местах, требует экспертизы по производству именно этого препарата, и связано с целой кучей правил чтобы показать FDA что производство стерильно и надежно производит именно то, что нужно в правильных дозах.

[bvlb]

а как относиться к новостям, о то, что есть новая вакцина с использованием mRNA (я не специалист) и её сегодня начали испытывать. Насколько это перспективно и действительно может сократить время до массовой доступности?

[shvarz]

Это очень экспериментальная вакцина. Нет ни одной подобной существующей вакцины даже в клинических испытаниях, которая бы показала эффективность. Если это сработает, то разработка вакцин очень ускорится. Посмотрим. На ДНК вакцины тоже была большая надежда, они неплохо работали в разных мелких животных, но оказались очень не-иммуногенными в людях.

[bvlb]

понятно, спасибо :/

[katyat]

А ДНК, продуцирующие нужные белки, имеют отношение к РНK вируса?

[shvarz]

Ну да, они сделаны на основе РНК последовательности вируса. Немного изменены, чтобы оптимизировать код для человеческих клеток, но все равно в клетке по этой ДНК синтезируется РНК, с которой потом считается белок. Так всегда работает - ДНК>РНК>белок.

[zlata_gl]

Очень странные результаты в Иране сравнительно с Европой

[p_k]

На nextstrain нет пока ни одной расшифровки из Ирана, так что разные или нет непонятно. Есть правда эпидемиологические данные, что часть заражений в Австралии шла через Иран. Там да, похоже отдельная ветка - но непонятно насколько это важно.

[shvarz]

Это скорее всего их подходы к диагностике и сбору статистики.

[fangorn_y]

>Летальность у них [в Иране] - гораздо выше, чем в Европе.

Выше, чем в Германии - Вы имели в виду?
Потому что в Италии - летальность 2158/27980 = 7,7%, а в Иране - летальность 853/14991 = 5,7%.

>А могут быть РАЗНЫЕ вирусы ?

Безусловно. Вирусы, как и ВСЕ живые организмы - постоянно мутируют и понемногу изменяются. Более того, окончания эпидемий чаще всего как раз и связаны с эволюцией вируса: когда у большинства уже появился к нему иммунитет, естественный отбор начинает отдавать преимущество хроническим легким (или вообще бессимптомным) формам вируса.
Тесты их НЕ различают. Различать их тем труднее, что с течением времени (недель, месяцев) разновидности одного вируса могут мутировать туда и обратно - в зависимости от направления естественного отбора (среди вирусов) в данном месте и времени.