Patient Zero
Возможно вы уже видели в новостях, что дескать новое исследование опровергло ключевую роль так называемого "patient zero" в распространении ВИЧ в Штатах. Была такая очень популярная идея, что был один стюард (гей), который заразился ВИЧ на Гаити а потом летал по Штатам и занимался сексом со всеми подряд (там три сотни партнеров за год) и что вот именно он то и разнес ВИЧ по всем Штатам и с него началась эпидемия.
Вообще говоря эта идея с самого начала не основывалась ни на каких научных данных, но очень уж красиво выглядела и поэтому распространилась очень широко.
В статье дается интересный экскурс в историю вопроса. Пациент этот фигурировал на самом деле под номером 57 среди всех случаев обнаруженных в Нью-Йорке, но было известно, что он имел контакты в Калифорнии и поэтому когда строились эпидеомиологические цепочки контактов среди группы геев в Калифорнии, то его включили в схему под буквой "O" (потому что он был outside - не из Калифорнии). Вот эта диаграмма:
Почти сразу эту букву "O" стали принимать за цифру "0" и так появился "пациент зеро". Идея стала особенно популярной с выходом книжки "And the band kept playing on", потому что печатное агенство решило, что история с "пациентом зеро" является очень интересной и построило вокруг нее маркетинг этой книги. Несмотря на множественные протесты со стороны авторов диаграммы, история прижилась среди общей публики (от специалистов мне ни разу не приходилось ее слышать).
В статье авторы пошарили по морозильникам и насобирали две тысячи старых (1978-1979 годов) образцов крови взятых от MSM в Нью Йорке и в Сан Франциско. Из них 3-7% оказались положительными на ВИЧ антитела. Живой вирус в них не сохранился, да и даже цельной РНК не сохранилось. Но путем довольно хитроумных манипуляций они смогли из сохранившихся кусочков собрать полные геномы для 8 образцов - 3 из СФ и 5 из НЙ. Эти геномы показали что в конце 70-х уже существовало изрядное разнообразие ВИЧ в Штатах и что вирус из "пациента зеро" лежит не в корне филогенетического дерева, а на одной из ветвей (что не согласуется с идеей о том, что он был основным источником ВИЧ эпидемии в Штатах). Эти геномы также позволили авторам восстановить раннюю историю ВИЧ в Штатах (перенос с Карибских островов в НЙ в 1970-71, а оттуда в Калифорнию), которая в принципе была уже известна, но эта работа дала ей дополнительное подтверждение.
Вообще говоря эта идея с самого начала не основывалась ни на каких научных данных, но очень уж красиво выглядела и поэтому распространилась очень широко.
В статье дается интересный экскурс в историю вопроса. Пациент этот фигурировал на самом деле под номером 57 среди всех случаев обнаруженных в Нью-Йорке, но было известно, что он имел контакты в Калифорнии и поэтому когда строились эпидеомиологические цепочки контактов среди группы геев в Калифорнии, то его включили в схему под буквой "O" (потому что он был outside - не из Калифорнии). Вот эта диаграмма:
Почти сразу эту букву "O" стали принимать за цифру "0" и так появился "пациент зеро". Идея стала особенно популярной с выходом книжки "And the band kept playing on", потому что печатное агенство решило, что история с "пациентом зеро" является очень интересной и построило вокруг нее маркетинг этой книги. Несмотря на множественные протесты со стороны авторов диаграммы, история прижилась среди общей публики (от специалистов мне ни разу не приходилось ее слышать).
В статье авторы пошарили по морозильникам и насобирали две тысячи старых (1978-1979 годов) образцов крови взятых от MSM в Нью Йорке и в Сан Франциско. Из них 3-7% оказались положительными на ВИЧ антитела. Живой вирус в них не сохранился, да и даже цельной РНК не сохранилось. Но путем довольно хитроумных манипуляций они смогли из сохранившихся кусочков собрать полные геномы для 8 образцов - 3 из СФ и 5 из НЙ. Эти геномы показали что в конце 70-х уже существовало изрядное разнообразие ВИЧ в Штатах и что вирус из "пациента зеро" лежит не в корне филогенетического дерева, а на одной из ветвей (что не согласуется с идеей о том, что он был основным источником ВИЧ эпидемии в Штатах). Эти геномы также позволили авторам восстановить раннюю историю ВИЧ в Штатах (перенос с Карибских островов в НЙ в 1970-71, а оттуда в Калифорнию), которая в принципе была уже известна, но эта работа дала ей дополнительное подтверждение.