Hенадежное копирование

[shkrobius]

Два года назад я рассуждал, почему с химической точки зрения вполне очевидно, что биополимеры, ответственные за хранение/копирование информации (нуклеиновые кислоты) и метаболизм (белки) должны быть разными (к ним предъявляются слишком разные требования

Comments

[alamar]

Мне это не кажется совсем невозможным, но проще, думаю, иметь несколько копий генома и всё время их восстанавливать по принципу "одинаковые 2 из 3". Проходиться по трём цепочкам и несовпадающее в одной из них исправлять.

Полиплоидные одноклеточные действуют подобным образом, но на уровне гена, а не нуклеотида. Всё время копируют гены с одной цепочки на другую, пока не останутся с одной версией.

[iv_an_ru]

При ненадёжных базовых операциях появляется риск неправильно посчитать, кто тут 2 из 3, либо вообще на ровном месте получить из трёх из трёх два из трёх.

[alamar]

Я бы предложил решить этот вопрос симуляцией.

[iv_an_ru]

Тогда чур не я --- из-за меня сейчас висит обновление bio2rdf , а потом я свалю отгуливать прошлогодний отпуск :)

Проблемка только в том, что судьбу каждого отдельного гена можно смоделировать несложным марковским процессом, но поглощающие состояния этих процессов не должны быть изолированы друг от друга, так что вся клетка оказывается одним единым процессом. Ошибка в копировании одиночного гена может быть и поглощающим состоянием для гена, и поглощающим состоянием для всей клетки, но возможны сценарии, когда ген почти безобидно "мутировал", но клетка с бОльшей вероятностью дохнет при одновременной мутации каких-то генов. Если это надо учитывать, а закон Мэрфи это обещает, то при вероятности ошибки при копировании 1/(N*N) и числе генов больше N модель будет занята в основном нудной проверкой, а не пора ли бацилле сдохнуть.

В принципе, прикольный курсовик кому-то можно дать.

[antontsau]

это всего лишь означает понижение вероятности успеха и рост затрат. Обнаружена любая ошибка - все в помойку, поехали заново. Даже если это ложная ошибка.

[iv_an_ru]

При вероятности необнаруженной ошибки 1/10000 и числе генов 10000 вероятность копирования без глюков будет 1/2.7 Это означает техническую возможность такого размножения, но при этом первый же конкурент с "качественным" копированием играючи победит в эволюционной гонке.

[antontsau]

Копировать конечно ген за геном а не все 10000 в одну цепь и только потом проверять. Не одна мегахромосома а 100500 мелких. Тогда затраты все равно огромные, но не настолько.