Первые признаки конфликта «сысоевцев» со священноначалием проявились еще в 2013-2014 годах, когда группа преподавателей и учеников ШПМ инициировала рассмотрение на заседаниях Синодальной библейско-богословской комиссии (СББК) «богословских заблуждений» Осипова, учителя многих ныне действующих священнослужителей РПЦ и «старшего товарища» патриарха Кирилла по экуменическому движению. Уступив под напором «сысоевцев», в 2015 году СББК приняла резолюцию, согласно которой высказывания профессора Осипова по пяти пунктам (о вечности геенских мук, о восприятии Христом первородного греха, об искуплении, о евхаристии, о крещении младенцев) спорны с точки зрения учения церкви. В дальнейшем группа преподавателей ШПМ пыталась инициировать аналогичное осуждение в отношении известного московского священника Георгия Кочеткова и добивалась лишения его сана - впрочем, безуспешно.
В том же 2015 году самый заметный преподаватель ШПМ, популярный миссионер священник Георгий Максимов включился в конфликт в Валуйской епархии и поддержал местного протоиерея Игоря Рыбалкина в тяжбе с епископом Саввой (Никифоровым) по поводу епархиальных взносов. Благодаря публикациям Максимова тема «мздоимства» в РПЦ и «конвертов для архиереев» стала предметом публичного обсуждения. Бескомпромиссный стиль Максимова проявился и в обсуждении увольнения митрополита Леонида (Горбачева) с поста главы Африканского экзархата РПЦ в сентябре 2023 года. В своем Telegram-канале Максимов осудил это решение патриарха и заявил, что оно «идет во вред делу Божьему, осуществляемому в Африке». Предположительно священноначалие до сих пор закрывало глаза на заявления Максимова, признавая его незаменимость в деле африканской миссии, ведь он один из активных служителей Африканского экзархата и в настоящее время находится в командировке в Кении.
Однако 30 июля Коллегия Синодального миссионерского отдела приняла решение о преобразовании образовательного проекта «Школа православного миссионера при Синодальном миссионерском отделе» в образовательный проект «Ортодоксия», реализуемый совместно с Православным Свято-Тихоновским гуманитарным университетом. Руководителем нового проекта был назначен протоиерей Александр Тимофеев, преподаватель кафедры библеистики Московской духовной академии, активно участвующий в церковном служении в зоне СВО. Формально основания для расставания с «сысоевцами» - чисто административные. Сотрудники ШПМ не работали в отделе официально и не имели богословского образования. Никакая «Школа» вообще не числилась в уставе отдела. При этом преподавателям ШПМ было обещано, что они в приоритетном порядке смогут участвовать в конкурсе на замещение преподавательских мест в новом проекте, а учащимся «Школы» предложено перейти на обучение в «Ортодоксию».
Руководство ШПМ не смирилось с решением епископа и начало активную кампанию против него в сети. В ролике под названием «Кто, как и зачем убивает ШПМ» Максимов заявил о своем «категорическом неприятии действий епископа Луховицкого Евфимия» как «глубоко безнравственных и наносящих ущерб миссионерскому делу». Максимов также настаивает, что Тимофеев, которого Евфимий назначил руководить проектом «Ортодоксия», «не имеет профильного миссионерского образования», «никогда до этого не занимался подготовкой миссионеров» и «совершенно не компетентен в сфере православной миссии», и это назначение, по мнению Максимова, - просто «кумовство» и «непотизм» со стороны архиерея (Моисеев и Тимофеев в свое время вместе учились и работали в Московской духовной академии). Последователи Максимова распространяют воззвание к патриарху Кириллу с призывом восстановить ШПМ в ее правах, обвиняют Моисеева и Тимофеева в «ереси эволюционизма».
https://www.ng.ru/ng_religii/2024-08-20/9_10_578_bishops.html