Организация зародилась на фоне принятия в 2005 году постановления Правительства РФ «О запрете к эксплуатации и ввозу в Россию автомобилей с правым рулем».
Затем региональными организациями проводились тематические пикеты и митинги, посвященные снижению цен на бензин, пересмотру транспортного налога, тарифов и правил ОСАГО, среди которых особо следует отметить акции в защиту Олега Щербинского, обвиненного в виновности в ДТП, приведшем к гибели губернатора Алтайского края Михаила Евдокимова, которыми тогда в первую очередь занимался Виктор Клепиков в Барнауле, получившие всероссийскую поддержку.
А 19 мая 2006 года, ровно через год после первой акции протеста, состоялся учредительный съезд региональных организаций и движений автовладельцев. Делегатами съезда, проведенного в Новосибирске, были представители семи самых активных на тот момент регионов и городов: Барнаула, Владивостока, Красноярска, Кемерова, Москвы, Новосибирска и Санкт-Петербурга.
Как показала практика, большинство проблем были общими, поэтому и решать их требовалось сообща.
Результатом съезда стало решение о создании Межрегиональной общественной организации «Федерация автовладельцев» для координации совместных действий, решения общих задач и лоббирования общих интересов.
Именно 19 мая 2006 года считается днем рождения ФАР.