Проблема в том, что веб-интерфейс битбакета вообще не отображает изменения в сабмодулях в изменениях.
Всех небезразличных прошу проголосовать за починку веб-интерфейса:
https://bitbucket.org/site/master/issue/8730/submodule-ref-changes-not-showed-in-web