В 1990 году был избран народным депутатом РСФСР, членом Верховного Совета РСФСР, как защитник верующих.
12 декабря 1991 года, являясь членом Верховного Совета РСФСР, проголосовал за ратификацию Беловежского соглашения о прекращении существования СССР.
В 1991-1992 годах участвовал в работе парламентской Комиссии по расследованию причин и обстоятельств ГКЧП.
В 1993 году Московской патриархией лишён сана священника, официально - за отказ подчиниться требованию о неучастии православных клириков в парламентских выборах.
В 1993-1995 годах - депутат Государственной думы.
Примерно в то же время Якунин подавал прошения о восстановлении его в сане священника.
11 сентября 1995 года стал участником драки в Думе. Николай Лысенко обвинил Якунина, что тот не имеет права носить рясу церковнослужителя, так как был лишён сана, после чего сорвал с него наперсный крест. В конфликт вмешались депутаты В. В. Жириновский, Е. Ю. Логинов и Е. Л. Тишковская. Согласно газете «Коммерсантъ», Жириновский «громко подсказывал: „Коля, бей его, души, рви рясу“!».
В 1997 году Якунин был отлучён от церкви за самочинное ношение иерейского креста и священнических одежд, а также общение с самозванным патриархом Киевским Филаретом.
С 2004 года священнослужитель Апостольской Православной церкви. Ответвления Истинной (Катакомбной) Православной Церкви.
На фото основатель РОА Власов с представителями Катакомбной ИПЦ.
Наше время, высказывания Глеба Якунина в одном из последних интервью:
Мы, демократы, религиозный авангард, мы против гомофобии. (с)
Я считаю, что великая, по-настоящему особая миссия у Pussy Riot. Я даже написал посвященный им небольшой сборник стихов «Пуссиниада». (с)
У нас пока нет подлинных людей, которые готовы создать христианскую партию. Но я думаю, что если Толоконникова и Маша Алехина возьмутся за создание христианской (как ни парадоксально звучит), подлинной христианской демократической партии. (с)
Умер 25/12/2014.
Poll Опрос