(Untitled)

[crocodile2010]

Сейчас в интернете можно найти массу научных статей, в которых описываются процессы, происходящие в организме на разных уровнях (тканевый, клеточный, молекулярный и т.д.). Сначала я пытался все это рисовать на бумаге, чтобы было потом удобнее анализировать, но со временем объем материала растет, и анализировать его вручную слишком долго. Поэтому

Comments

[ice_blackwell]

Сходу видно, что надо как минимум учесть память системы - даже одноклеточные организмы могут обучаться и очень по-разному реагировать на первое и последующие воздействия. У вас память не учтена.

Имхо вам сюда

[immortaz]

sbml.org

Re: Имхо вам сюда

[crocodile2010]

Спасибо, погляжу

[crocodile2010]

Сама база - раз,
в процессе моделирования состояния узлов и стрелок будут запоминаться - два

[objmihail]

А данные у вас будут я так понимаю в свободном доступе? )
У меня довольно похожая система, где-то около 1000 узлов, могу вам залить в Excel. Никаких других таких баз не встречал, только схемы разные (которые я и скопипастил в основном).
А вот насчет словаря я не понял: зачем он нужен?

[crocodile2010]

Пока это все только в начале пути.
Думаю, как только появится результат, который нестыдно показать, хочу оформить на каком-нибудь сайте, только придется еще некоторое время потратить на web-интерфейс
Словать нужен
1) для хранения дополнительной информации об используемых терминах
2) для хранения слов-синонимов
3) для исключения дублирования
Предполагая, что заливать в Excel смогут разные люди, каждый это будет делать немного по-своему, а система должна уметь все приводить к одному формату
Чуть попозже пришлю образец, что хочется увидеть

[objmihail]

Ясно, удачи ) Присылайте.

[crocodile2010]

Образец с описанием выложил тут
http://narod.ru/disk/20407425000/obrazec.xls.html

[vovix_ldr]

Что-то похожее я видел на каком-то англоязычном ресурсе... OpenWetWare, что ли. Автор занимается синтетической биологией ака DIYbio?

[crocodile2010]

Нет, синтетической биологией не занимаюсь, но чувствую, что некоторые вещи сделать могу

[crocodile2010]

Че-то мой браузер не хочет окрывать, ни 6-й, ни 8-й :(
Насчет назкоуровневой реализации согласен, но может, чего появится из готового софта
Сам пока писать не собираюсь, для меня в данный момент важнее начинка, а по трудоемкости больше всего времени сожрет даже не программирование, а формализация знаний для базы

[m_batin]

очень круто