Шутки кончились: в моей ДНК мусора нет!
5 сентября 2012 опубликованы первоначальные результаты проекта Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE), всего около 30 статей в таких журналах как Nature, Genome Biology, and Genome Research. Показано, что по крайней мере 80% т.н. некодирующей части ДНК в человеческом геноме биологически активно, а не является т.н. мусором, как еще недавно было принято считать. Это крайне интересно, т.к. до 98% всего человеческого генома было принято считать мусорным или безполезным, в то время как только малая часть предполагалась ответственной за примерно 22тыс белковые последовательности.
Показано, что большая часть генома, не связанная с кодированием белков, выступает в роли переключателей, взаимодействующих с элементами за пределами генома и друг с другом и, таким образом, регулирующих трансляцию генов (всего около 4М "переключателей"). Количество возможных состояний такой системы огромно, а конкретные состояния могут очень сильно варьироваться от клетки к клетке даже в одной ткани. 5% этой некодирующей части высоко-консервативна между различными видами животных.
Вопросы и комментарии:
- биологию трудно "учить", меняется быстрее чем история :)
- разнообразие живого за окном было бы трудно описать только вариацией генов, теперь степеней свободы стало больше
- все труднее будет себя убеждать о том, что конкретные патологии могут быть связаны с одним геном или мишенью. По сути это еще один уровень регуляции сродни эпигенетической.
- вместо связки "ген-мишень-болезнь" правильнее было бы говорить о состояниях генетической сети, состоящей из генов и их регуляторов
- хороший транспазон - мертвый транспазон
- 4М генов это уже не генетика, а теория поля, а заболевания это не мисэкспрессия а фазовый переход (или лучше тут, скоро напишу подробнее).
Click to viewПоказано, что большая часть генома, не связанная с кодированием белков, выступает в роли переключателей, взаимодействующих с элементами за пределами генома и друг с другом и, таким образом, регулирующих трансляцию генов (всего около 4М "переключателей"). Количество возможных состояний такой системы огромно, а конкретные состояния могут очень сильно варьироваться от клетки к клетке даже в одной ткани. 5% этой некодирующей части высоко-консервативна между различными видами животных.
Вопросы и комментарии:
- биологию трудно "учить", меняется быстрее чем история :)
- разнообразие живого за окном было бы трудно описать только вариацией генов, теперь степеней свободы стало больше
- все труднее будет себя убеждать о том, что конкретные патологии могут быть связаны с одним геном или мишенью. По сути это еще один уровень регуляции сродни эпигенетической.
- вместо связки "ген-мишень-болезнь" правильнее было бы говорить о состояниях генетической сети, состоящей из генов и их регуляторов
- хороший транспазон - мертвый транспазон
- 4М генов это уже не генетика, а теория поля, а заболевания это не мисэкспрессия а фазовый переход (или лучше тут, скоро напишу подробнее).