Диагностика SARS-CoV-2 инфекции. Конкурент ПЦР?

Dec 06, 2020 21:46


В этом году слово ПЦР прочно вошло в повседневный лексикон. С помощью ПЦР и, реже, других методов амплификации нуклеиновых кислот диагностируют SARS-CoV-2 инфекцию (об этом подробнее здесь: https://prof-afv.livejournal.com/6425.html; https://prof-afv.livejournal.com/5607.html). Однако, этот пост не о ПЦР. Я понимаю, что то, как работают методы ( Read more... )

crispr/cas9, Диагностика, covid-19, cas13a, sars-cov-2, ПЦР

Leave a comment

aleks_visero December 8 2020, 05:08:13 UTC
Вы не поняли. Совсем. Я утверждаю, что тесты "срабатывают" на некий нуклеотид, который а) не факт что относиться к вирусу вообще и не является фрагментом нормально генома человека или иных "коронавирусов" б) это срабатывание не говорит что человек заражён именно новой коронавирусной инфекцией. А по поводу симптомов, я вам процитирую

Для этого заболевания характерен инкубационный период 2-10 дней. Для короткого продромального периода характерна повышенная утомляемость, анорексия, умеренная головная боль. Больных может беспокоить преходящая диарея.

Затем состояние больного резко ухудшается, в течение нескольких часов температура тела стремительно повышается, достигая 40 °C. Это повышение температуры сопровождается ознобом, резким усилением головной боли, нарастающей адинамией, болями в мышцах, иногда - болями в суставах. В первый день часто отмечается сухой кашель, позже появляется компонент мокроты. Мокрота, как правило, слизистая, реже - слизисто-гнойная. Очень редко отмечается кровохарканье. Больные могут предъявлять жалобы на колющие интенсивные боли в груди. Эти боли, как правило, усиливаются при кашле и при глубоком дыхании. Боли в груди - признак развития плеврита. Нарастающая острая дыхательная недостаточность диагностируется у 20-30 % больных и требует респираторной поддержки.

Помимо поражения лёгких, при болезни поражаются и другие органы и системы. Внелёгочная симптоматика в ряде случаев может даже доминировать над симптоматикой пневмонии. В основном она обусловлена интоксикацией. У больных могут отмечаться симптомы поражения желудочно-кишечного тракта: тошнота, рвота, боли в животе, диарея. Для болезни характерно увеличение размеров печени. Заболевание может сопровождаться нарушением сознания, дезориентацией в месте и времени, дизартрией. Могут развиваться судороги, мозжечковые нарушения. Острая почечная недостаточность при болезни вторична - её развитие является следствием инфекционно-токсического шока.

Лихорадочный период обычно длится около двух недель, при благоприятном лечении далее отмечается медленное выздоровление с длительным сохранением явлений астении. В тяжёлых случаях больные погибают в связи с нарастающей дыхательной недостаточностью, а в условиях продолжительной реанимации - от полиорганной недостаточности.

Какое заболевание описано? Оно похоже на Ковид?

Reply

woj_lj December 8 2020, 07:28:26 UTC
> Вы не поняли. Совсем.

Вы утверждаете, что, проведя миллион тестов, мы получим 970 тысяч положительных результатов безотносительно того сколько в выборке было реально заболевших. Этот тезис легко опровергается статистикой: в мире за год было проведено порядка полумиллиарда тестов. Что именно я не понял?

> тесты "срабатывают" на некий нуклеотид

Не на "некоторый", а на "один из", входящих в реальный вирус ковид-19. Напомню, что вирус был выделен, а его геном расшифрован. Нельзя исключатать, что выбранный для тестов фрагмент (или фрагменты) широко распространены в популяции безотносительно ковида, но за это отвечает разработчик теста: специфичность - это один из ключевых показателей который нельзя просто декларативно заявить, его надо показать. В используемых на данный момент тестах специфичность варьируется в диапазоне 92%-99% в зависимости от разработчика.

> это срабатывание не говорит что человек заражён именно новой коронавирусной инфекцией

В случае высокой специфичности теста очень неплохо говорит. Другое дело, что есть такой параметр как чувствительность теста, но это уже про ложноотрицательные случаи. Недостаток чувствительности хорошо компенсируется просто повторным тестированием.

> Какое заболевание описано? Оно похоже на Ковид?

Я не врач, но гуглить умею. Что именно следует из того, что два заболевания могут иметь схожие симптомы? Грипп и ОРВИ имеют почти идентичные симптомы, и даже сезонность у них совпадает, но при этом это два разных заболевания, вызываемых совершенно разными вирусами. Мы же с вами речь про тесты вели. Они не симптомы проверяют, а наличие следов конретного вируса.

Reply


Leave a comment

Up