Новый проблемный вариант SARS-CoV-2 отнесен к потенциально наиболее опасным и назван «омикрон»

[prof_afv]

На сегодняшнем заседании Группы экспертов ВОЗ мониторирующей эволюцию SARS-CoV-2, мутации в вирусном геноме и их влияние на биологию вируса (The Technical Advisory Group on SARS-CoV-2 Virus Evolution - TAG-VE) принято решение включить вариант  B.1.1.529 в группу наиболее проблемных (VOC - Variant Of Concern) и назвать его «омикрон» (вопреки

Comments

[polit_buro]

100% вытеснение Дельты это конечно хорошо, только общее число проб аж 6


https://covariants.org/per-country

Да и общее число "больных" в ЮАР не так, чтобы сильно подскочило:

[yura314]

7-day rolling average резкий рост может сгладить немного (хотя без него тоже плохо - влияют недельные колебания количества тестов).
Тем не менее, если переключиться на логарифмическую шкалу, где экспоненциальный рост преобразуется в линейный тренд, становится видно, что если тенденция сохраниться, это будет куда более быстрая волна, с показателем R заметно больше


см. https://ourworldindata.org/coronavirus/country/south-africa

Хотя я понимаю, что пока что тренд может переломиться, и чтобы уверенно строить подобные экстраполяции по скорости роста, наверное нужно еще неделю-две подождать, тем более что вначале волны дельты тоже есть маленький участок со "стремительным" ростом.

[polit_buro]

Они начали включать быстрые тесты в статистику, причем еще и задним числом.

https://sacoronavirus.co.za/2021/11/23/media-statement-health-department-adds-antigen-tests-on-the-line-list-of-covid-19-statistics/

[yura314]

Нетрудно перестроить график самостоятельно, исключив из данных точку с "выбросом" из-за включения большого числа тестов
Исходные данные есть вот тут https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19/tree/master/csse_covid_19_data/csse_covid_19_time_series
Построил случаи за последние 200 дней, четко выдно выброс 5 дней назад. Его влияние на среднее можно устранить, заменив эту точку ("выброс") просто средним арифметическим двух соседних дней.


По этим очищенным данным можно также перестроить и бегущее среднее



Штриховая линия - случаи с учетом добавление антигенных тестов, сплошная синяя - бегущее 7-дневное усреднение очищенных данных. Логарифмический масштаб, зеленые линии - линейный фиттинг, больший угол наклона по отношению к оси абсцисс говорит о потенциально большей скорости распространения.

И последнее - если смотреть на на количество случаев, которое в том числе зависит от числа тестов, а % положительных тестов, причем в провинции в которой началась вспышка, то рост выглядит еще более удручающим

[andy_ms]

из блога https://yourlocalepidemiologist.substack.com/p/new-concerning-variant-b11529
«Хотя есть и хорошие новости

Во-первых, мы можем обнаружить B.1.1.529 с помощью ПЦР-теста. Обычно это не так. Обычно мазок нужно направлять в специальную лабораторию для секвенирования генома, чтобы узнать, какой вариант вызвал инфекцию. Однако похоже, что B.1.1.529 имеет специальный сигнал, такой как Alpha, непосредственно на PCR. Например, при положительном результате PCR загораются два канала вместо трех, указывая, что это B.1.1.529. Это потрясающая новость, потому что это означает, что мы можем гораздо проще и быстрее отслеживать этот вирус по всему миру.

Во-вторых, мы очень рано поймали этот вирус. Я не могу не переоценить, насколько удивительно Южная Африка умеет общаться и справляться с ситуацией. Благодаря своей быстрой реакции ученые всего мира уже работают вместе, чтобы расшифровать эту новую угрозу. Раннее обнаружение означает, что у нас есть система наблюдения, и она работает.

В-третьих, если нам понадобится еще одна вакцина, мы сможем сделать это невероятно быстро. Благодаря новой биотехнологии мРНК-вакцины действительно легко изменить. После внесения незначительного изменения всего 2 дюжины человек должны зарегистрироваться в испытании, чтобы убедиться, что обновленная вакцина работает. Затем его можно будет распространить на вооружение. Поскольку изменение небольшое, обновленная вакцина не требует испытаний фазы III и / или регулярного утверждения. Таким образом, весь этот процесс должен занять максимум 6 недель. Мы не слышали от Moderna или Pfizer, начали ли они создавать обновленную вакцину, но я гарантирую, что разговоры начались за закрытыми дверями.»

[prof_afv]

"In the event that vaccine-escape variant emerges, Pfizer and BioNTech expect to be able to develop and produce a tailor-made vaccine against that variant in approximately 100 days, subject to regulatory approval," Pfizer said in a statement.

Moderna said it been developing a strategy since early 2021 to respond to new variants of concern and has identified three response options. The first is doubling the dose of its current COVID-19 booster from 50 micrograms to 100 micrograms.
"The 100 (microgram) dose of mRNA-1273 has also recently been studied by the National Institutes of Health (NIH) in the U.S. and has generally resulted in the highest neutralizing titers against prior SARS-CoV-2 strains," Moderna said in a statement. It said it's already dosed 306 people to test safety and efficacy.
Moderna said its second strategy is testing two multi-valent booster candidates that were designed to anticipate mutations like those found in the omicron variant.
The third, Moderna said, is to quickly develop an omicron-specific booster. The company said it's already worked on this for other variants, including Delta. Moderna said it has been able to get booster candidates to clinical testing within 60-90 days.

[andy_ms]

The third, Moderna said, is to quickly develop an omicron-specific booster.
Мяу же! Умнички!!!
Имхо и векторные вакцины удастся перенастроить очень быстро. Всё-таки,мы не на уровне Дженнера, а далеко шагнули )))

[vasja_iz_aa]

для Дельты между тем как она вызвала большое беспокойство и до естественного спада волны прошло приблизительно полгода. Модерна говорит, что ей надо три месяца или несколько меньше до начала испытаний. после чего сотни миллионов доз надо произвести, доставить и уколоть. еще пара недель на развитие иммунитета. арифметика очень простая

[bublik4]

Ура! Больше вакцин, хороших и разных!

[andy_ms]

Умница! Лучше убийцу опознавать по фотороботу, а не по итогам кровопролитной неожиданной схватки в темной подворотне.

[ext_2847218]

Статистика пока небольшая



https://twitter.com/jburnmurdoch/status/1463956686075580421

[polit_buro]

Они начали включать быстрые тесты в статистику, причем еще и задним числом.

https://sacoronavirus.co.za/2021/11/23/media-statement-health-department-adds-antigen-tests-on-the-line-list-of-covid-19-statistics/

[ext_2847218]

А как быстрые антигенные тесты определяют штамм вируса, ну тоесть каких включение должно якобы менять статистику по новому штамму?

[polit_buro]

Вариант и ПЦР не определяет. Это надо специально расшифровывать геном. Но включение антигенных тестов в статистику раздувает число заражений, по сравнению с предыдущими периодами и искажает статистику.

[ext_2847218]

Этот конкретный штамм определятся ПЦР тестами

[polit_buro]

Я имел ввиду, что обычный ПЦР тест не сообщает, какой именно вариант выявлен. Надо секвенировать.