Про микробов внутри нас

[motek]

Когда я только начинала учиться в университете, все говорили про Проект Генома Человека. С тех пор его давно закончили (но ответы на многие вопросы он так и не дал), и теперь на повестке Проект Микробиома Человека. Оказывается, в нас живет около сотни триллионов бактерий (главным образом на коже и в желудочно-кишечном тракте, ЖКТ), что составляет

Comments

[motek]

:) Я этот пост уже год рожаю, но написался он в итоге очень быстро. :) Это я еще не все, наверное, рассказала, только самое основное, что запомнила. Тема интересная, вопрос только, могут ли в нею сделать свой скромный вклад такие простые люди как я, далекие от компьютерных технологий. Но чувствую, иммунология (типа моя тема - хотя тоже темный лес) на сегодня не имеет смысла без изучения этого самого микробиома.

[motek]

Спасибо. :)

[grihanm]

Прикольно :)

Но пара вещей резануло:

"но ответы на многие вопросы он так и не дал"
Я бы так не писал. Он как бы и не должен давать ответы сразу на все вопросы. Информация из проекта выложена в свободный (как минимум для учёных) доступ - и ей постоянно пользуются при куче исследований и по сей день и будут пользоваться ещё 100500 лет.

Есть сейчас ещё один классный проект кстати - 1000 геномов

"хотя по некоторым мнениям, отчасти эффект первоначальной микрофлоры остается на всю жизнь"
А насколько эти мнения обоснованны? Мне почему-то кажется это чисто фричество

[motek]

То что без него мы никуда, это понятно (я сама геномным браузером пользуюсь постоянно), просто это как всегда - чем больше мы узнаем, тем больше у нас вопросов. Насколько я помню, когда-то думали, что, ну скажем, мы сможем найти "ген ожирения", "ген депресии" и т.п., а тут оказывается, что есть генетика, а есть эпигенетика, и вообще все дело в микрофлоре. :) Так что "1000 геномов" может и важный проект - но далеко не все написано у нас в генах.

[grihanm]

Ну просто это звучало как "Колумб открыл америку, но, дрянь такая, привёз оттуда всего лишь миллиардные доли процента от всего тамошнего золота" :)

1000 геномов - это больше для ген-болезней кажется, +для историографии

[motek]

Насчет второго вопроса.
Насколько я поняла из того что читала, часть микрофлоры взрослого человека таки задается ранним эффектом. В том смысле, что какие-то виды там когда-то появились и закрепились навсегда, типа того. В биологии ведь много чего происходит с помощью процессов с положительной обратной связью. Ну, кроме того какие-то исследования говорят про эффект изначальной микрофлоры (или способа родов или вскармливания) и те или иные болезни, но тут, понятно, все корелляции. А предполагаемый линк - это иммуная система, т.к. она и микрофлора влияют друг на друга (или даже формируют друг друга, особенно в начале жизни) - про это есть масса исследований.

[x_ginger]

Во-первых привет, спасибо за интерес и добро пожаловать ко мне:)
Во-вторых, можно ведь на ты, правда?

А в третьих, очень интересная тема, и интересно посмотреть как она будет развиваться со временем. Я помню, когда я только начинала учится, такая область фармакологии, как фармакогеномика только только зарождалась. Тогда только-только обнаружили гены, ответственные за метаболизм различных лекарств. Сегодня к этому уже вовсю подключились medical regulatory authorities.

[motek]

Привет, конечно на ты, и спасибо. :) Мне твои комменты в разных местах понравились, а оказалось, что мы к тому же почти коллеги. :)
Гены ответственные за метаболизм лекарств - не знала, что есть такие (это стало быть объясняет то что некоторые лекарства работают скажем только на азиатах или только на белых). Но раз есть, тем более есть и такие микробы. :)

[yelya]

Гены ответственные за метаболизм лекарств - не знала, что есть такие

Львовна, ты че как дите малое? :) Почитай про cytochrome P450, и тебе откроется много нового.

[motek]

Слушай, я почитала и мне таки открылось! Действительно, как я раньше про это не знала (но я фармакологией особенно никогда не интересовалась, видимо подозревала как это сложно). :) Очень интересно на самом деле.

[gview]

Oчень интереснo. У меня всегдa вызывaлo прoтест и недoумение, кoгдa прo кaкую-тo бoлезнь гoвoрят, будтo бы oнa не нaследственнaя и не инфекциoннaя. A тaкoе гoвoрят кaк рaз o ряде aутиoмунных бoлезней. Нaпример, если oдин из близнецoв бoлен рaссеянным склерoзoм, верoятнoсть тoгo, чтo oн прoявится у втoрoгo близнецa - всегo треть.

Чтo же oстaётся? Влияния среды? Кaк-тo неубедительнo для тaкoгo рaдикaльнoгo и длительнoгo физиoлoгическoгo oтклoнения. Вoт в этoм смысле генoм и сoстaв симбиoтическoй микрoфлoры мoгут oчень крaсивo вписaться в кaртину.

[motek]

Да, может быть. Но вообще, много чего в нашей жизни, мне кажется, происходит довольно случайно. Т.е. совокупность каких-то случайных и не очень факторов - так карта легла - и развивается болезнь. Микрофлора тоже отчасти образуется случайно, т.к. имеют эффект "стохастические факторы" раннего детства (но и среда тут как раз важна, а немного и гены играют роль). Как я говорила комментом выше, в биологии много процессов с положительной обратной связью - и пошло-поехало, запускается какое-то устойчивое изменение. Так мне это видится. Но иммуная система это очень сложная вещь, а взаимодействие с микрофлорой ее еще больше усложняет.

[gview]

Я имел в виду, чтo лoгичнo предпoлoжить, чтo при бoлезни, кoтoрaя нaчинaется вo взрoслoм сoстoянии и длится гoдaми, причём вoлнooбрaзнo - релaпс-ремиссия,- причинa не в кaкoм-тo единoрaзoвoм вoздействии, a в чём-тo, пoстoяннo присутствующем в oргaнизме или вблизи негo, и oкaзывaющем длительный эффект. Нaличие чужих генoв в системе кaк рaз идеaльнo сooтветствует тaкoму oпределению.

[motek]

Что-то в этом есть!
http://www.nature.com/nature/journal/v479/n7374/full/nature10554.html
(см. справа, Editor's Summary).

[yelya]

Ага, связь имунной системы и микробиоты давно известна, я заявку на эту тему писала. :)

[motek]

Видишь, какая ты была прозорливая. :) Куда заявку? И в каком контексте?
Известно давно, что связь есть, но в чем она заключается это не так уж известно, тем более, что разные виды бактерий научились определять совсем недавно, благодаря сиквенированию, ведь раньше, кажется, их просто пытались высевать, а большинство из них вообще анэробные. А разные виды явно влияют по-разному.

[yelya]

Заявку на патент. Правда, я ее забыла, как страшный сон.
Посмотри статьи вот этой тетки: http://www.hms.harvard.edu/dms/immunology/fac/Mathis.php