Пишет адмирал флота, бывший Главком ВМФ СССР:«Атрина» - слово искусственное, его нет ни в каких словарях. Мы не хотели, чтобы даже смысловой оттенок кодового слова мог что-то сказать о разрабатываемой операции. По этому же принципу давались названия и другим ее этапам - «Фермацит» и др.
Чернавин В. Н.
Операция «Атрина» // Тайфун: Военно-технический альманах. - 2000. - № 6.
Однако поиск показывает, что вроде бы «atrinus» («черноватый») - редкое латинское прилагательное, которое используется в биологической номенклатуре. И вообще слова и географические названия с этим корнем встречаются. Так придавали этому слову смысл или нет? Видимо, это и есть наша главная военная тайна.