for biologically inclined friends

[eugene_koonin]

some recent stuff of potential general interest:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22913395
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22993722

Comments

[flying_bear]

Спасибо! Настолько general, что даже я прочитал (вторую статью, первая что-то не грузится) с иллюзией понимания и огромным интересом.

[eugene_koonin]

Спасибо!
Неожиданно и очень, конечно, приятно.
Странно, что первая не грузится, сбросил
по email на всякий случай

[flying_bear]

Получил! Большое спасибо.
Я прочитал Вашу книгу, хоть, конечно, и не могу похвастать, что все понял.

А до этого читал старательно всякие популярные книжки по молекулярной биологии, которые страшно раздражали шапкозакидательством. Многие мои коллеги почему-то торчат от упрощений. А мне, наоборот, страшно нравится читать про то, как все на самом деле сложно устроено.

И, конечно, очень хочется понять, что такое сложность. Но вряд ли удастся.

[eugene_koonin]

Well, I surely remember you read my book, your high opinion was great support.
As for popular books...it is a matter of perspective. I practically cannot open most of those
in biology (of course, there are exceptions like Gould but those are different, that's real literature)
but quite like some in physics (of course, written by physicists not science writers) but then again, that
might be mostly because I am a dilettante there.

It seems to me the big question is not so much WHAT is complexity (like pornography, when we see it, we know it,
and mathematically it can be defined in a variety of ways, it is not so hard) but rather where does complexity come from?
Or, why are there complex systems around rather than simple (and highly efficient) ones only? I think there also some tentative answers (eg in the aforementioned book) although I certainly would not suggest these are anywhere near definitive.

[flying_bear]

С определением тоже все очень непросто, мне кажется.
Вот некоторые дискуссии у меня в ЖЖ:
http://flying-bear.livejournal.com/245805.html?thread=3510829#t3510829
http://flying-bear.livejournal.com/632906.html?thread=11174730
http://flying-bear.livejournal.com/300552.html
http://flying-bear.livejournal.com/580350.html (там очень длинные дискуссии, но ключевые утверждения, наверно, понятны при беглом пролистывании)
Кое-что из этого мы вместе с kdv2005 (он прекрасный специалист по теории вероятности) пытались формализовать, но безуспешно.

[eugene_koonin]

Thanks!
There seem to be really interesting thoughts in this discussion, like this, just as an example:
Кстати... есть еще такое - сложные системы должны быть fragile.

[flying_bear]

Да. Были потом (у нас) попытки описать сложность как нечто возникающее на границе упорядоченного и хаотического поведения, но ничего вразумительного не получилось.