про аутизм
Я все читаю про аутизм. И про генетику. Вот уж где непаханное поле, и невалянные кони.
Аутизм это спектр расстройств. Их объединяют в одну кучу только потому, что непонятно, как их делить. Раньше пробовали делить на аутизм и синдром Аспергера, а теперь передумали и объединили их обратно в одну категорию.
Вот в этой http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/cge.12101/pdf статье аутизм обсуждается с точки зрения генетики. У некоторых детей с аутизмом есть только симптомы аутизма, и больше никаких других (это в статье называется non-syndromic ASD). А у некоторых кроме аутизма есть еще другие: неврологические расстройства, микроцефалия, макроцефалия, аномалии костей и внутренних органов (syndromic ASD).
Причина аутизма всегда в генах. Но это могут быть разные сочетания генов.
ОДин крайний вариант - когда есть одна крупная поломка в ДНК. Обычно это так называемая de novo мутация - у родителей мутации нет, она случилась в одной из родительских клеток или уже в самом эмбрионе. Но есть варианты - например, транслокация: допустим, у одного из родителей ген целиком перекочевал из одной хромосомы 2 в хромосому 7. Количество генов все равно сходится, так что все в порядке. Но если ребенку достанется хромосома 2 с геном и хромосома 7 с лишним геном, ген окажется в двойном экземпляре и получится передозировка того вещества, которое он производит.
Другая крайность - когда куча небольших мутаций, которые по отдельности безобидны, оказывается вместе и вызывают катастрофический эффект. На самом деле, это даже не мутации, a common variants, которые встречаются у немаленького количества людей. В этом случае каждый из родителей носит в себе половину этих вариантов, и когда они все вдруг достались одному человеку, развивается аутизм.
Важный вопрос для родителей - какова вероятность, что и у следующего ребенка будет аутизм? Можно ли это как-то предотвратить? В первом случае поломку найти нелегко. Если это не совсем уж гигантская делеция, то так просто в микроскоп её не разглядишь. Если нет никаких гипотез, на какой хромосоме искать, то придется секвенировать весь геном, а это долго и все еще очень дорого.
Впрочем, найти ген-виновник - это еще не значит хорошие новости. Потому что про большую часть генов нам пока неизвестно, что они делают и зачем они вообще. Очень часто функция гена обнаруживается только тогда, когда родится ребенок с мутацией в этом гене. Ага, так этот ген может вызывать дислексию, будем знать! В той статье перечислены те гены, которые нам уже известны, их тестируют в первую очередь - PTEN, SHANK, FMR1. Но это капля в море по сравнению с числом генов, которые потенциально могут вызывать аутизм. Вот уж действительно, ищем там, где светло.
Но тут по крайней мере хоть что-то можно сказать. Но если поиски мутаций ни к чему не привели - значит, причина в неудачном совпадении множества common variants. И здесь вообще ничего не сделаешь, потому что этих common variants без преувеличения миллионы, это даже не поиск иголок в стоге сена, у меня подходящей метафоры не придумывается.
В общем, картина пока получается неутешительная. Статья заканчивается словами There is still much to be learned и надеждами на то, что полное секвенирование генома подешевеет (впрочем, оно-то как раз дешевело, дешевеет и будет дешеветь, в этом сомневаться не приходится)
Аутизм это спектр расстройств. Их объединяют в одну кучу только потому, что непонятно, как их делить. Раньше пробовали делить на аутизм и синдром Аспергера, а теперь передумали и объединили их обратно в одну категорию.
Вот в этой http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/cge.12101/pdf статье аутизм обсуждается с точки зрения генетики. У некоторых детей с аутизмом есть только симптомы аутизма, и больше никаких других (это в статье называется non-syndromic ASD). А у некоторых кроме аутизма есть еще другие: неврологические расстройства, микроцефалия, макроцефалия, аномалии костей и внутренних органов (syndromic ASD).
Причина аутизма всегда в генах. Но это могут быть разные сочетания генов.
ОДин крайний вариант - когда есть одна крупная поломка в ДНК. Обычно это так называемая de novo мутация - у родителей мутации нет, она случилась в одной из родительских клеток или уже в самом эмбрионе. Но есть варианты - например, транслокация: допустим, у одного из родителей ген целиком перекочевал из одной хромосомы 2 в хромосому 7. Количество генов все равно сходится, так что все в порядке. Но если ребенку достанется хромосома 2 с геном и хромосома 7 с лишним геном, ген окажется в двойном экземпляре и получится передозировка того вещества, которое он производит.
Другая крайность - когда куча небольших мутаций, которые по отдельности безобидны, оказывается вместе и вызывают катастрофический эффект. На самом деле, это даже не мутации, a common variants, которые встречаются у немаленького количества людей. В этом случае каждый из родителей носит в себе половину этих вариантов, и когда они все вдруг достались одному человеку, развивается аутизм.
Важный вопрос для родителей - какова вероятность, что и у следующего ребенка будет аутизм? Можно ли это как-то предотвратить? В первом случае поломку найти нелегко. Если это не совсем уж гигантская делеция, то так просто в микроскоп её не разглядишь. Если нет никаких гипотез, на какой хромосоме искать, то придется секвенировать весь геном, а это долго и все еще очень дорого.
Впрочем, найти ген-виновник - это еще не значит хорошие новости. Потому что про большую часть генов нам пока неизвестно, что они делают и зачем они вообще. Очень часто функция гена обнаруживается только тогда, когда родится ребенок с мутацией в этом гене. Ага, так этот ген может вызывать дислексию, будем знать! В той статье перечислены те гены, которые нам уже известны, их тестируют в первую очередь - PTEN, SHANK, FMR1. Но это капля в море по сравнению с числом генов, которые потенциально могут вызывать аутизм. Вот уж действительно, ищем там, где светло.
Но тут по крайней мере хоть что-то можно сказать. Но если поиски мутаций ни к чему не привели - значит, причина в неудачном совпадении множества common variants. И здесь вообще ничего не сделаешь, потому что этих common variants без преувеличения миллионы, это даже не поиск иголок в стоге сена, у меня подходящей метафоры не придумывается.
В общем, картина пока получается неутешительная. Статья заканчивается словами There is still much to be learned и надеждами на то, что полное секвенирование генома подешевеет (впрочем, оно-то как раз дешевело, дешевеет и будет дешеветь, в этом сомневаться не приходится)