онотоле, вращайте!

Dec 10, 2015 12:21

Вчера я наконец-то взяла себя в руки и переработала 3 отдельных маленьких программки на питоне, предназначенных для того, чтобы одна и та же молекула абстрактного почти сферического фотосенсибилизатора в вакууме (ну, или не в вакууме) из разных расчетов была бы ориентирована в пространстве относительно системы координат одним и тем же способом. Часто, когда расчеты делают разные люди, то молекулы ориентированы по-разному, и результаты потом тяжело сравнивать. Кроме того, добрый милый Гауссиан (которым бы я с радостью не пользовалась совсем, но приходится) сам любит во время оптимизации молекулы вращать их и, внимание! иногда еще выворчивать наизнанку, что в свое время попортило мне немало крови, когда я долго и очень усердно пыталась развернуть результаты Гильберта в мои координаты. И с тех пор у меня так и валялись три очень неудобных скрипта, в которых без ста грамм не разберешься, даже если ты их автор!
Но со вчерашнего дня я у меня есть единая программа, подгоняющая ориентацию к нужной. Для этого программе нужно указать два файла с координатами, которые программа прежде всего центрирует, 2 референсных атома, сравнивая которые, программа определяет метом сканирования нужные углы поворота в сферических координах. Полученные углы она использует дальше, разворачивает молекулу и результаты выдает чудесные, красиво отформатированные файлы.

Вы знаете, я не слишком люблю программирование, но почему-то не могу оторваться и программирую все подряд... Подумываю над тем, чтобы пройти полный курс Питона на курсере, чтобы набить в голову более последовательных что ли знаний. Демотивирующим тут является затраченное на курс время, а также то, что я и методом поиска на stackoverflow могу решить любую проблему. Но если пройти курсы, то не нужно будет по пустякам лазить по программерским форумам, что не так уж и плохо.


научное, kuehn

Previous post Next post
Up