первые результаты по неначатому проекту
Пока у нас была пробная лицензия на Шрёдингер, а я ваяла промежуточный отчет по вычислительному каталитическому проекту, наш аспирант Косала полностью в первом приближении новый медицинский проект, который мы с группой Осамы даже еще не начали официально делать. Под этот проект нам купят лицензию на Шрёдингер и тогда все результаты докинга, которые Косала успел получить, нужно будет переделать, разрешая белку в процессе приделывания к нему разных молекул тоже шевелиться. Такую задачу можно сделать только на вычислительном кластере с нормальной лизенцией. Но уже даже в предварительном виде отчет, который написал Косала, выглядит очень наукообразно. И мы можем быть уверены в том, что проект получится и публикация у нас будет. Никогда не думала, что влезу в область медицинского моделирования, но кажется, я уже там. Волшебство какое-то!
Программа такая "тяжеловесная", что на компьютере Косалы она даже не может рисовать белок в виде разноцветных спиралек - при попытках всё подвисает. Но двумерные карты взаимодействия лигандов с белковыми цепочками получаются. Вот так, например:
Программа такая "тяжеловесная", что на компьютере Косалы она даже не может рисовать белок в виде разноцветных спиралек - при попытках всё подвисает. Но двумерные карты взаимодействия лигандов с белковыми цепочками получаются. Вот так, например: