Многим хорош Kicad, свободен, кросплатформенен и многое умеет, но есть у него и странные вывихи в пользовательском интерфейсе.
Сегодня пытался соединить переходными два полигона с верхней и нижней стороны платы, хотел сделать теплоотвод и нарвался на неприятную особенность. Каждый раз после сохранения файла, вокруг переходных зияли чёрные кружки без меди. Выручил как всегда google engineering. После того переходные были расставлены по дорожкам соединённым с цепью из которой строился полигон, всё заработало!
Было:
То что надо сделать, чтобы всё работало (заливка с полигонов снята):
Результат: