И там, как я кажется усвоил ещё со школы, хромосомы нормально реплицируются целыми. А фрагментация упоминается как нарушение, например в опухолях.
Понятно, что нарушения репликации нормально целой ДНК время от времени нарушается, происходит мутация, хромосомы уже не идентичны, но их похожесть обнаруживается на уровне фрагментов, так? и на этом и основана ДНК-генеалогия, верно? Частота мутации в одной хромосоме примерно 7,5 к ста, как написано здесь: https://ark.wiki.gg/ru/wiki/%D0%9C%D1%83%D1%82%D0%B0%D1%86%D0%B8%D0%B8
А вероятность того, что при делении мутации будут сразу в двух хромосомах, равна 0,000625.
Тут между тётей и племянником фрагментированы сразу все хромосомы. Нет вообще общих целых. Как мне казалось, у тёти и племянника в норме должно быть 50% целых хромосом. А тут - фрагментов. Это на картинке вообще насколько близкие родственники?
Честно говоря, меня больше интересуют следствия тех или иных биологических процессов, чем их биологические тонкости. Я историк по образованию, поэтому не буду пытаться как-то аргументированно расписать.
Сейчас многие сервисы позволяют наглядно увидеть количество и расположение общих сегментов на отдельных хромосомах. Вот, к примеру, у меня с родной тетей.
Click to view
На картинке мы имеем набор хромосом, каждая из которых фрагментирована.
Может быть, я в генетике не копенгаген, прошу извинить и объяснить мне, тупому. Вот читаю про митоз: https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9C%D0%B8%D1%82%D0%BE%D0%B7
И там, как я кажется усвоил ещё со школы, хромосомы нормально реплицируются целыми.
А фрагментация упоминается как нарушение, например в опухолях.
Понятно, что нарушения репликации нормально целой ДНК время от времени нарушается, происходит мутация, хромосомы уже не идентичны, но их похожесть обнаруживается на уровне фрагментов, так? и на этом и основана ДНК-генеалогия, верно? Частота мутации в одной хромосоме примерно 7,5 к ста, как написано здесь: https://ark.wiki.gg/ru/wiki/%D0%9C%D1%83%D1%82%D0%B0%D1%86%D0%B8%D0%B8
А вероятность того, что при делении мутации будут сразу в двух хромосомах, равна 0,000625.
Тут между тётей и племянником фрагментированы сразу все хромосомы. Нет вообще общих целых.
Как мне казалось, у тёти и племянника в норме должно быть 50% целых хромосом.
А тут - фрагментов. Это на картинке вообще насколько близкие родственники?
Я вот это прошу прокомментировать
Reply
Сегментов.
Честно говоря, меня больше интересуют следствия тех или иных биологических процессов, чем их биологические тонкости. Я историк по образованию, поэтому не буду пытаться как-то аргументированно расписать.
Сейчас многие сервисы позволяют наглядно увидеть количество и расположение общих сегментов на отдельных хромосомах. Вот, к примеру, у меня с родной тетей.
"Близкие биологические родственники имеют идентичные друг другу достаточно длинные фрагменты ДНК и, соответственно, в большинстве хромосом находятся идентичные по происхождению блоки значительной длины (> 66.7 сМ), в результате чего ожидаемая длина общих IBD составляет около 1700 сМ. Согласно расчетам, двоюродные и троюродные родственники, вероятно, будут иметь несколько регионов (более 2.5 сегментов) из-за наличия недавних предков, определяющих их род ство. Предполагается, что для двоюродных родственников каждый IBD будет иметь общую длину больше 62 сМ и для троюродных - 25 сМ. Дальние родственники, относящиеся к четвероюродным или более дальним кузенам, с большой вероятностью несут один или несколько регионов от своего ближайшего общего предка. Такие пары включают в себя подавляющее большинство людей в конкретной популяции и обычно называются «неродственными», поскольку ожидается, что доля и число IBD по всему геному будут между ними относительно не большими (Gusev et al., 2012). "
https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-022-05066-2
Reply
Reply
Leave a comment