От искры пожара этнического конфликта в Бурунди разгорелась война в соседней Руанде. Все началось с того, что 6 апреля 1994 года близ аэропорта Кигали в Руанде ракетой «земля-воздух» сбит самолет, в котором находились президенты соседних стран Бурунди и Руанды Сиприен Нтарьямира и Жювеналь Хабияримана.
В Руанде гибель президента, принадлежавшего к народности хуту, вызвала цепную реакцию мести в общенациональном масштабе. Армия Руанды, состоявшая из хуту, развернула против тутси массовые репрессии. 7 апреля солдаты-хуту убили свою одноплеменницу - премьер-министра страны Агату Увилингиямане - из-за ее «умеренности»: беременной главе правительства вспороли живот.
Увилингиямане охраняли 10 бельгийских и 5 ганских миротворцев ООН, но они сложили оружие, когда были окружены солдатами президентской гвардии Руанды. Боевики молодёжного отделения правящей партии, известного как «интерахамве», расправились с Агатой, ее мужем и еще несколькими людьми. Чудом уцелели только дети премьер-министра, спрятанные одним из сотрудников ООН.
А новым премьером стал один из инициаторов геноцида -- Жан Камбанда. В считанные дни были вырезаны все умеренные политики-хуту, в том числе пять министров и глава конституционного суда. Покончив с «предателями» из числа соплеменников, экстремисты-хуту приступили к «окончательному решению» национального вопроса. По государственному радио объявлялись сборы отрядов боевиков «интерахамве» и «импузамугамби». Мэры выдавали им заранее подготовленные списки тутси, подлежащих уничтожению. В основном они в качестве оружия использовали мачете, топоры, дубины, палки, железные прутья. Иногда убийцы сначала отрезали своим жертвам пальцы, кисти, стопы, руки, ноги, и только после этого отрубали голову или разбивали череп. Свидетели рассказывали, что часто жертвы просили своих палачей и предлагали им деньги за то, чтобы их застрелили, а не зарубили мачете. В случае затруднений на помощь ополченцам приходили солдаты армии, имеющие более тяжелое оружие: взрывали запертые двери, забрасывали помещения гранатами.
Число убитых за 100 дней составило по разным данным от 500 000 до 1 030 000 человек. Скорость убийств превышала в пять раз скорость убийств в немецких концлагерях в годы Второй мировой войны. Не повезло многим и из тех, кто остался в живых. Было изнасиловано около 250 тысяч женщин и девочек. При этом значительную их часть заразили СПИДом.
Спустя месяц после начала резни ООН создала Международный трибунал по военным преступлениям в Руанде. По оценкам экспертов, жертвами геноцида, включая умерших от голода и болезней, стало не менее 800 тыс. Почти миллион руандийцев бежал в сопредельные страны.